長江口內(nèi)頗具規(guī)模的港口有上海港及江蘇沿江蘇州、南京、南通、鎮(zhèn)江、江陰、常州、泰州、揚(yáng)州8個(gè)港口，擁有萬噸級(jí)以上泊位約340個(gè)，目前沿江主要港口及大部分電廠專用泊位均可靠泊靈便型散貨船及巴拿馬型船，其中上海和南通港擁有可停泊10萬噸級(jí)船舶的泊位。而上海五號(hào)溝港區(qū)正著手建能兼顧靠泊15萬噸級(jí)集裝箱船的泊位，蘇州太倉港區(qū)正著手建15萬噸級(jí)礦石中轉(zhuǎn)碼頭，并規(guī)劃發(fā)展成為上海國際航運(yùn)中心集裝箱干線港。隨著水深-12.5米航道延伸到南京的目標(biāo)實(shí)現(xiàn)，沿江5萬噸級(jí)以上泊位將會(huì)迅速發(fā)展。 
　　我國船舶工業(yè)迅速發(fā)展，至2006年造船總量達(dá)1450余萬載重噸，居世界第三位。長江三角洲地區(qū)是我國現(xiàn)代造船工業(yè)的發(fā)源地，占我國船舶工業(yè)的半壁江山。中國船舶工業(yè)集團(tuán)總公司的五大船廠中有4家（江南、滬東中華、外高橋和上海）集中在上海，2006年完工量近550萬載重噸，頗具規(guī)模；江蘇沿江聚集了七大船廠中遠(yuǎn)川崎、新時(shí)代、揚(yáng)子江等，2006年完工量達(dá)300余萬載重噸，合計(jì)850余萬載重噸，占全國造船總量的60%，其中有30萬噸級(jí)VLCC、好望角型散貨船、超巴拿馬型集裝箱船、海上鉆井平臺(tái)和儲(chǔ)油船等大型船舶，正在建造，另14.6萬m3大型LNG船、20萬噸以上的礦石專用船，以及全球最大的圓形海洋鉆井平臺(tái)等超大型船舶也在著手建造。此外，還包括振華港機(jī)廠大型集裝箱裝卸橋的整機(jī)裝運(yùn)船舶，這些都將是以后通過長江口深水航道的新增船型。
　　長江口深水航道建成后，總長92.2公里，D12燈浮至D50燈浮航道底寬350米，設(shè)標(biāo)寬度500米，D1燈浮至D12燈浮航道底寬400米，設(shè)標(biāo)寬度550米。深水航道底寬維護(hù)水深為理論最低潮面以下12.5米。
　　由于航道進(jìn)一步增深，結(jié)合各貨類的運(yùn)營組織特點(diǎn)，預(yù)測進(jìn)出長江口的散貨船將以靈便型和巴拿馬型散貨船為主，而裝載鐵礦石的好望角型船和20萬噸級(jí)超大型礦砂船將進(jìn)一步增加；由于甬滬寧原油管道的運(yùn)營，進(jìn)出長江口的油船不會(huì)很大，將以靈便型船和巴拿馬型油船為主；集裝箱船仍因其網(wǎng)絡(luò)運(yùn)輸?shù)男枰��?0000TEU以內(nèi)的超巴拿馬型集裝箱船為遠(yuǎn)洋干線的主力船型，即以3000TEU~8000TEU型集裝箱船為主，近洋航線以1000TEU~2000TEU集裝箱船為主，內(nèi)貿(mào)航線以500TEU~1500TEU集裝箱船為主。其他貨船以3萬噸級(jí)以下船舶為主。
　　12.5米航道開通后，5萬噸級(jí)（載箱量4000TEU左右）集裝箱船、靈便型散貨船、2萬噸級(jí)油船和3萬噸級(jí)雜貨船均無需乘潮即可全天候進(jìn)出深水航道；7萬噸級(jí)（載箱量5500TEU左右）集裝箱船、3萬噸級(jí)油船和4萬噸級(jí)雜貨船需乘1.5米潮；10萬噸級(jí)（載箱量8000TEU左右）集裝箱船、大靈便型散貨船、5萬噸級(jí)油船需乘2米潮；12萬噸級(jí)（載箱量9000TEU左右）集裝箱船、巴拿馬型散貨船和油船需乘2.5米潮。由于集裝箱運(yùn)營組織的需要，每次進(jìn)出航道的船舶不會(huì)滿載，大部分航次的船舶營運(yùn)吃水小于設(shè)計(jì)吃水，故集裝箱船的乘潮水位相對低些。
　　由于長江口深水航道的建設(shè)，航槽穩(wěn)定、航道水深加深、航寬加大，使進(jìn)出長江口的船舶流量大幅增加，航速提高，船型不斷變大，將促進(jìn)上海國際航運(yùn)中心的形成，為長三角地區(qū)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展起到巨大的推動(dòng)作用。隨著三期工程建設(shè)的推進(jìn)，航道水深將增深至12.5米，屆時(shí)5萬噸級(jí)集裝箱船和靈便型的散貨船、油船、雜貨船均無需乘潮即全天候進(jìn)出深水航道，而巴拿馬型、好望角型船等通過減載、乘潮進(jìn)出航道，進(jìn)出長江口深水航道的船舶進(jìn)一步增加、增大。長江口深水航道工程將發(fā)揮更大的作用。