隨著港區建設的日趨完善和通關環境的優化，南沙新港業務量快速上升，今年前4月進出口總值達到7.7億美元，比上年同期增長3.1倍。其中出口3.7億美元，增長1.6倍；進口4億美元，增長6.8倍。

據廣州海關統計，2004年南沙新港開放之初，港口進出口貨物尚未形成規模，2005年港口貨運量逐漸攀升，2006年進一步增長達到129.9萬噸，比2005年增長1.7倍。2007年首4月，南沙新港進出口貨運量持續攀升，達到64萬噸，大幅增長81.9%，港口貨運量顯示出強勁的增長勢頭。

　　目前，包括馬士基航運集團在內的世界排名前10位的航運公司，已有9家在南沙新港開辟了航線，國際航線總數量已達15條，覆蓋歐洲、美洲、非洲和亞洲多個主要港口。2006年經南沙新港出口貨物的運抵國家和地區共計118個，比2005年增加38個；經南沙新港進口貨物來自33個啟運國家和地區，比2005年增加10個。