6月27日，微軟突然宣布與國家計委簽署金額超過62億元的諒解備忘錄。這一“迄今為止中國在軟件領域最大的一個對外合作項目”在信息產業部和科技部均不知情的情況下，引發業界嘩然。 
　　消息公布第二天，另兩條驚人的消息在業界飛速流傳：
　　——“微軟與國家計委成立合作委員會，曾培炎任主任，巴爾默任副主任�！� 
　　——“62億元合作意向書的簽署，意味著國家計委已經全面采納了微軟關于中國軟件產業發展戰略的建議�！� 
　　去年9月，微軟高價聘請麥肯錫為其撰寫《中國軟件產業發展戰略研究報告》，并秘密提交國家計委。
　　這份標明“機密”、據稱花費1000萬美金的報告長達150多頁，主要由四部分組成：第一部分，以全球信息產業和軟件業發展現狀為背景，闡述中國發展軟件產業的重要性和必要性，并在此基礎提出中國軟件業發展的“5個遠景目標”；第二部分，分析中國軟件業的發展階段、現狀、其競爭優劣勢及其在全球市場中的位置，提出中國軟件發展應分“3個階段”進行；第三部分，參照愛爾蘭和以色列軟件業發展中政府的角色定位，提出中國政府發展軟件的“7大舉措”；最后部分，闡述在推動中國軟件發展中微軟能夠作出的“4個貢獻”。
　　“機密報告”的主導思想秉承了微軟高管的一貫論調：中國軟件業應該效仿硬件走“貿工技”，即以市場換技術之路。因而，該報告給中國在世界軟件市場中的定位是“以發展應用軟件為主的、以滿足龐大的國內市場需求為主的軟件出口國”。
　　7月3日，記者致電國家計委高新技術司信息產業處邢處長。這位在與微軟合作的談判過程中計委方面的主要人物表示，“我們不會完全按照微軟的報告來做”，而且邢處長一再強調，在62億的意向書中，“計委沒有任何承諾(包括在政府采購方面)，主要都是微軟向我們承諾”。
　　但是，知悉“麥肯錫報告”內容的軟件界專家和政府人士仍然驚呼：“這會要了中國自主的軟件產業的命！” 
　　分歧仍在 
　　在“機密報告”中，微軟指出：中國軟件業的發展需要跨部委協調。此觀點，一針見血地指出了從上世紀80年代初中國軟件的“第一次浪潮”到現在“第三次浪潮”中，制約中國軟件產業化發展的一大弊端：政府各部門多頭管理。報告舉例說，直接參與中國軟件產業政策(2000年18號文件)制定和實施的部委，至少有13家。
　　而在1998年之前，基礎極其薄弱的軟件業遠沒有這般紅火�？萍疾炕鹁嬷行挠嬎銠C軟件處邱曉玲處長回憶說，中國最早跟軟件沾邊的管理部門僅有科技部、原電子工業部和外經貿部。
　　90年代初，第一批外資軟件公司進入中國后，享受著比本土企業更多的優惠政策，在此情況下，本土在80年代末成長起來的包括金山在內的第一批商業軟件公司頓時“哀鴻遍野”。因為意識到“中國軟件企業處于生死存亡的關頭”，1995年3月，邱曉玲處長聯合其他兩個部委的兩位處長向尚未就任科技部部長的徐冠華報告，該報告后來確立了中國軟件必須“建立軟件園走集中發展之路”的發展模式。1995年10月，第一批包括4個軟件園在內的4個軟件園獲得科技部授牌。
　　在邱曉玲看來，1997年10月，六大部委聯合在天津舉辦的“全國軟件產業工作座談會”，必須作為一塊里程碑載入中國軟件業發展史。這是因為，軟件上第一次引發眾多部委的共同關注”。邱處長回憶說，為了邀請其他部委參會她騎單車天天跑各大部委，當時去找計委時，計委根本沒有管軟件的人。
　　在網絡泡沫破滅、硬件和通訊基礎設施全球飽和的大背景下，2000年下半年，隨著18號文件的發布，軟件業在中國急劇升溫。
　　18號文件確立信息產業部為軟件業的主管部門，而國家計委作為中國的宏觀規劃部門，亦拿出巨額款項支持軟件發發展，2001年10月，計委與信產部在科技部原認定的20個軟件園的基礎上，重新認定11家“國家級軟產業基地”�！爸匦抡J定”引發軟件管理的“歷史功臣”科技部的不滿，中國軟件管理存在的部門協調問題，第一次見諸報端。(來源支點網)
　　2002年2月，朱镕基總理訪印歸來后指示中國軟件要在2年內趕超印度，引發了各部委趕制“趕超方案”的熱潮。4-5月間，科技部和信產部分別提交中國軟件發展戰略報告。
　　中國的軟件產業是主要依靠自身力量發展？還是主要借靠外力？是要發展完整的產業鏈？還是在別人的平臺之上超越式發展？曾經參與兩個部委的軟件發展報告起草過程的一些人士認為，政府尚沒有真正想明白。
　　但是，200年6月27日，國家計委與微軟CEO巴爾默簽署的一紙協議，為中國這些年來關于軟件發展模式的探討里程劃出了一道“分水嶺”。國家計委為代表的主張，此次壓倒了以信產部、科技部以及北京市科委(北京市軟件業 的主管部門)為代表的“主張”。后者不僅長期以來為Linux和“自主的、完整的軟件產業鏈”搖旗吶喊，還在去年年底的北京市政府采購中付諸實行。
　　部門協調不力，在一定程度上妨礙了18號文件的有效實施。有鑒于此，微軟在“機密報告”中提議。中國有必要成立一個跨部委的機構對軟件業進行管理并對產業政策的執行進行協調。
　　目前看來，能夠而且已在承擔此責任的，是國家信息化領導小組和國家信息化領導辦公室(國信辦)。而國家計委主任曾培炎，兼任該小組副組長及辦公室主任。中國目前電子政務工程的最高指揮權，亦歸屬于此。微軟此番可謂“一石兩鳥”。