2008年10月，深圳赤灣完成貨物吞吐量474.4萬噸，比去年同期減少7.9%。赤灣港區、媽灣港區完成集裝箱吞吐量44.4萬TEU，比去年同期減少19.4%，其中赤灣港區完成集裝箱吞吐量31.7萬TEU，比去年同期減少23.1%；散雜貨吞吐量完成70.9萬噸，比去年同期增長21.4%。2008年截至10月末，深圳赤灣累計完成貨物吞吐量5411.0萬噸，比去年同期增長9.5%，其中赤灣港區、媽灣港區累計完成集裝箱吞吐量515.7萬TEU，比去年同期增長2.6%。赤灣港區累計完成集裝箱吞吐量365.1萬TEU，比去年同期增長0.9%；散雜貨吞吐量累計完成652.1萬噸，比去年同期增長10.2%。