重慶海關關長馬忠源接受本報記者專訪時表示，重慶兩路寸灘保稅港區將于本月18日正式開港，該保稅港區獨具「河港+空港」的「一區雙功能」新模式，將空港與河港納入保稅港區屬全國首創。他明確指出，海關對保稅港區區內監管容易，但對于稅區貨物經長江沿線運輸上的監管難度很大，但海關會盡一切力量做到最好。 
海關總署盛光祖署長曾指出，「重慶寸灘港如果實行保稅港區，監管的特點將和上海洋山港完全不一樣，監管難度更大，需要有新的有針對性的措施和辦法」。馬忠源關長稱，重慶海關將按照「一線放開、二線管住、區內自由」的監管理念，運用先進的技術裝備，創新監管理念和改革監管模式，對保稅港區「雙功能」區之間貨物實施無縫隙監管：采取「一次申報通關，卡口聯動放行」的方式進行監管。 
船貨離境水面監管難 
他稱，重慶保稅港區海關監管需政府、海關齊心協力共同打造。但貨物進了保稅港區可以保稅，重慶乃至西部企業的貨物入區以后就退稅，對企業而言是出口，但對于海關而言，貨物雖然出口但還沒有離境，離境還需重慶寸灘港至上海5天5夜的航程，再換海船經洋山港出境要7天，這7天里面船不靠岸、集裝箱不離船，貨不離箱很難，所以海關在特殊監管方面要做很多工作，監管難度很大。希望長江沿線主要碼頭給予運送重慶保稅港區貨物的船只，在特定口岸給予指定裝卸區，利于海關監管。 
針對長江沿線海關的監管正在深入調研，重慶保稅港區與沿海其它保稅港區完全不一樣，海關用什么樣的方式監管是最大的難題，海關把方便留給了地方企業，但下一步的監管正在研究。 
四點監管新方案 
馬忠源透露，目前海關初步上報國務院審批的方案，第一要選擇符合海關監管要求的服務運輸工具以及信得過的企業，甚至還要采取信用擔保，我們才能準企業運輸保稅港區的貨物到上海去。第二在監管手段上要對船舶進行全程的監控；第三就是要與長江沿線的海關，包括武漢宜昌、長沙岳陽、江蘇南京、上海洋山等海關聯動，共同建立研究辦法，在總署的領導下，大家聯手進行管理；第四，我們要組成一支長江沿線聯合巡查小分隊，如果保稅港區的貨物在長江航線途中偏離航線，巡查小分隊隨時上船進行檢查，必要的時候我們還要派海關人員隨船監管押運至上海洋山。