兩岸海運直航后，臺灣海峽兩岸航運協會董事長王龍雄預計下月率團赴北京，與大陸海峽兩岸航運交流協會協商。  　　交通運輸部發給長榮、陽明海運一個月效期的船舶營運證，可望換發一年期，延長到明年12月31日止，所有船公司屆時再一并檢討直航成效。 
　　海運直航15日鳴笛，獲準通行的船舶行經兩岸不必再彎靠石垣島，節省時間及工本。 
　　根據海運協議，兩方船公司必須向大陸、臺灣各提出航線申請，大陸為審批制，臺灣為許可制。但兩方給的公司證、船舶證效期不同。 
　　島內交通部門航政司指出，包含大陸及臺灣航商申請經營兩岸直航航線，島內航政部門給的公司、船舶證照皆為兩年。不過，據了解，大陸方面給直航船公司水路運輸批文為三年，但船舶營運證則有一個月一航次、半年及一年期，效期不一。 
　　據悉，交通運輸部為做總量管制，兩岸三地航線新進業者或新航線，包含長榮、陽明及大陸中遠、中海集團四家，船舶營運證為一航次，效期僅一個月，至明年1月中旬到期。 
　　原本行駛兩岸三地航線的船公司，則統統給一年期，至明年12月31日止。萬海、臺航、中外運、上海海華等，都是到明年底到期。不過，大陸的山東海豐有一艘掛香港籍的權宜船，船舶營運證則為半年期。 
　　長榮、陽明表示，由于一個月效期快到，當前已向交通運輸部重新提出申請。長榮指出，“一定不會斷航”，陽明也很樂觀，認為交通運輸部會續發證照。 
　　臺航會指出，長榮及陽明預計將可換發一年期證照，和既有航商相同，均在明年12月31日到期，兩岸到時再來檢討直航的成效。下月初，“小兩會”也將碰面，雙方再確認運行細節。 
　　據指出，大陸海航會本月初來臺拜訪臺航會，這次換由臺航會赴北京協商，雙方維持良好交互，“小兩會”將就散裝航線，以及集裝箱船公司原本行駛兩岸三地航線要彎靠第三地，現在不用彎靠第三地，航線可否加靠一個港口等進行討論、確定。