為重構(gòu)政府權(quán)力，弱化部門利益，減少部門掣肘，避免政出多門、職能交叉等弊病，并且切實(shí)提高行政效率，降低行政成本的目的，國務(wù)院于本次機(jī)構(gòu)改革會(huì)議中正式新組建5大部委，其中物流行業(yè)比較關(guān)心的就是交通運(yùn)輸部（以下簡(jiǎn)稱“運(yùn)輸部”）。
新組建的運(yùn)輸部涵蓋了原交通部、國家民航總局、國家郵政總局以及建設(shè)部指導(dǎo)客運(yùn)的綜合職能。 
對(duì)于運(yùn)輸部的組建，很多人認(rèn)為打破了航空、水運(yùn)、公路、郵政、城交等涉及運(yùn)輸部門的部分分割，條塊分割，從而利于形成立體化的大交通。
然而對(duì)于現(xiàn)實(shí)意義的物流行業(yè)來說，雖然我們一直在呼喚綜合交通運(yùn)輸體系的建立和完善，但是從本次運(yùn)輸部的成立來看，只是簡(jiǎn)單的功能疊加，責(zé)權(quán)的重新分配而已，運(yùn)輸部也并不是眾多人幻想的促進(jìn)物流發(fā)展新空間、加快綜合物流的發(fā)展步伐的靈丹妙藥。
中國物流不可能因?yàn)榻M建一個(gè)新的運(yùn)輸部就取得行業(yè)大發(fā)展，更不能出現(xiàn)跨越式的發(fā)展。必須要承認(rèn)，新組建的運(yùn)輸部對(duì)于物流行業(yè)的發(fā)展有較大的促進(jìn)意義，但是我們也必須要清醒的認(rèn)識(shí)到它的局限性和負(fù)面作用：
一、交通運(yùn)輸部，一種殘缺的美。
新組建的運(yùn)輸部涵蓋了天空、公路、水運(yùn)以及城市交通客運(yùn)多個(gè)板塊的功能，具有一定的綜合性，是一個(gè)較大的進(jìn)步，但是缺少管道運(yùn)輸，尤其是鐵路運(yùn)輸?shù)慕煌ㄟ\(yùn)輸部絕對(duì)不能稱之為完美。在中國，航空運(yùn)輸和水運(yùn)都不是必備的常態(tài)運(yùn)輸方式，而公路和鐵路運(yùn)輸是最基本的交通方式，因此不管是何種理由而缺少了鐵路運(yùn)輸這一重要環(huán)節(jié)，如何稱得上完美呢？
二、交通運(yùn)輸部，運(yùn)營機(jī)制的質(zhì)疑點(diǎn)。
此次大部制改革，體現(xiàn)了三權(quán)分立的原則，即決策、執(zhí)行、監(jiān)督機(jī)制的應(yīng)用。作為全國行業(yè)的主管部位在內(nèi)部如何實(shí)現(xiàn)三權(quán)的有機(jī)運(yùn)轉(zhuǎn)，是一個(gè)對(duì)國家宏觀部門的考驗(yàn)，責(zé)權(quán)利的不均衡導(dǎo)致很難真正體現(xiàn)權(quán)利的相互制約和平衡，因此在運(yùn)轉(zhuǎn)一段時(shí)間后，必然會(huì)重新走上官本位的道路，而背離建設(shè)服務(wù)性政府的出發(fā)點(diǎn)。
三、交通運(yùn)輸部，內(nèi)部權(quán)利的失衡。
作為之前的幾大部、局相互整合成立一個(gè)新的運(yùn)輸部，必然導(dǎo)致的是權(quán)利的短暫失衡，在一段時(shí)間后，是否會(huì)出現(xiàn)不通專業(yè)出身的管理者為了各自主管的行業(yè)爭(zhēng)權(quán)奪利的局面？新組建的運(yùn)輸部?jī)A向于將水運(yùn)、航空、公路、郵政分別單獨(dú)成立子局，由副部長兼任，在一定程度上較大了協(xié)調(diào)的難度。
四、交通運(yùn)輸部，能夠走出歷次改革模式失敗的怪圈？
“精簡(jiǎn)—膨脹—再精簡(jiǎn)—再膨脹”，這就是我國歷次政府部門改革的軌跡，到最后往往不堪重負(fù)，推倒重新再來。作為交通運(yùn)輸部新合并的多個(gè)專業(yè)部、局來說，第一部分管理者級(jí)別下降，但是權(quán)利并沒有變化，改革意義何在？第二相互之間必然會(huì)加大人員隊(duì)伍的建設(shè)力度，從而顯示自己的主管部分的重要性。最終人浮于事的情況比比皆是。
五、交通運(yùn)輸部，最大的改革阻力所在。
“權(quán)力部門化，部門利益化，利益集團(tuán)化”， 部門利益是改革的最大障礙和攻堅(jiān)關(guān)鍵。此次改革與前五次最大的不同是，“大部制”方案中加入了“決策、執(zhí)行、監(jiān)督”分立的意圖。即對(duì)“三權(quán)”進(jìn)行厘清、分立歸屬，并使其互相制約，形成良好的權(quán)力制衡與監(jiān)督的運(yùn)行機(jī)制；并不是簡(jiǎn)單地把職能相近、業(yè)務(wù)雷同部門合并或拆減。但是觸及相關(guān)部位的利益底線是否能夠得到有效貫徹執(zhí)行是令人深深懷疑的。
六、交通運(yùn)輸部，大象還是猴子？
合并了多個(gè)部、局的運(yùn)輸部現(xiàn)在給人的感覺更像是一頭巨象，雖然運(yùn)輸行業(yè)的基礎(chǔ)理論是一樣的，但是作為管理部位來說，新的運(yùn)輸部是否還可以像之前的部、局一樣，保持靈活性以及縱深性是值得深思的一件事情，如果僅僅是權(quán)利的疊加，而變成了一個(gè)臃腫的貴婦，從而喪失了對(duì)于運(yùn)輸行業(yè)的宏觀有效調(diào)控和清晰的模塊規(guī)劃，那對(duì)于中國的綜合交通運(yùn)輸而言，不亞于一場(chǎng)災(zāi)難。
七、交通運(yùn)輸部，審批流程及權(quán)限對(duì)物流行業(yè)的影響。
之前的民航總局對(duì)于所有涉及航空的事情都要管理，郵政總局對(duì)于郵政的業(yè)務(wù)也是一樣，而對(duì)于新的交通運(yùn)輸部而言，可以講是多了一個(gè)婆婆而已，并且國家發(fā)改委也同時(shí)有個(gè)交通司，起到協(xié)調(diào)的功能。對(duì)于這種架構(gòu)而言，是否意味著未來再組建新的航空貨代公司需要再多報(bào)一個(gè)層級(jí)，而在中國多一個(gè)層級(jí)就意味著多打通好幾個(gè)關(guān)系��！時(shí)間以及金錢都將是巨大的浪費(fèi)，無疑會(huì)降低想要進(jìn)入這個(gè)行業(yè)的人士熱情。
同時(shí)，對(duì)于新組建的交通運(yùn)輸部是否可以理解為，只要一個(gè)紅章，其他的運(yùn)輸方式都可以操作了呢？并且對(duì)于快遞行業(yè)來說，針對(duì)郵政總局以后是不是可以直接向交通運(yùn)輸部提請(qǐng)?jiān)V訟了呢？很多很多不明朗的事情，都是疑云一樣籠罩在物流人士的頭上。
八、交通運(yùn)輸部，對(duì)物流行業(yè)影響因待產(chǎn)誤時(shí)而意義不大。
中國的物流行業(yè)已經(jīng)基本完成了部局，除非有大的投資者進(jìn)入，采取非常規(guī)的運(yùn)作手法整合相關(guān)物流資源，會(huì)產(chǎn)生較大的變化外，按照正常的發(fā)展道路而言，出現(xiàn)較大波動(dòng)性的可能性以及不存在。
言外之意是，中國現(xiàn)在對(duì)物流行業(yè)已經(jīng)徹底實(shí)現(xiàn)了對(duì)外開放，因此全面競(jìng)爭(zhēng)已經(jīng)打響。同時(shí)大型國有物流企業(yè)也基本已經(jīng)成型，而向中遠(yuǎn)、中海提出的海運(yùn)以及鐵路的誤會(huì)問題，那純粹是節(jié)點(diǎn)的問題，不代表兩個(gè)行業(yè)的問題，并且對(duì)于中遠(yuǎn)、中海這種副部級(jí)單位而言，可以直接提出改革方案。而對(duì)于大型民營物流企業(yè)而言，其運(yùn)作內(nèi)容較為清晰，并且鐵道部對(duì)于鐵路貨運(yùn)改革也是持歡迎態(tài)度，基本上可以憑借實(shí)力進(jìn)行承包，而原有的交通部開放程度更為成熟。真正有難度的運(yùn)輸方式是管道運(yùn)輸，但是因?yàn)楣艿肋\(yùn)輸?shù)幕�礎(chǔ)性以及專用性，其實(shí)和我們通常理解的交通運(yùn)輸有較大的差別，因此并不為人所關(guān)注。
因此，對(duì)于物流行業(yè)而言，無論是外資還是國有亦或是民營，都已經(jīng)基本完成了部局，如果交通運(yùn)輸部能夠在十年前，哪怕是五年前成立，都將會(huì)對(duì)現(xiàn)有的物流格局產(chǎn)生重大的影響，但是在今天一切都基本定局的情況才組建此部位，難免有應(yīng)景之疑。
綜上所述，充分認(rèn)識(shí)到交通運(yùn)輸部組建后的積極意義，但更要清楚的知道它的弊端和局限性，只有這樣才能更好的做出發(fā)展道路的決策選擇，同時(shí)破除大部制的迷信思想，充分發(fā)揮其優(yōu)勢(shì)避其劣勢(shì)，才能促進(jìn)行業(yè)的大發(fā)展，乃至于跨越式發(fā)展。