馬尾港是福建省7個對外開放的港口之一，除了廈門港以外，它的出口貿易量占全省的50%以上。 　　為了更好的了解這個港口對海峽建設的貢獻，日前記者走訪了福州邊防檢查站。從那里了解到，從馬尾港出發的兩岸交流航線，是福建省7個港口中最全面的，其中客運方面，就是從馬尾港到臺灣馬祖島的“兩馬航線”；而貨運方面的航線有四條，第一條是馬尾到高雄，是集裝箱貨運直航，這個航線是每天都有的，花費的時間比較短，從馬尾港到高雄只需10小時就可以了，但集裝箱出口量卻是占福建省的50%；第二條是馬尾到馬祖的貨運直航航線，也是每天都有船只往返，這些船只主要的是向臺灣地區運輸沙石和礦料石等建筑材料；第三條航線是馬尾到澎湖的航線，這條航線是2007年1月份開通的，因為目前除了集裝箱以外，其他建筑材料和散貨是不可以運到臺灣本島，所以在外島開辟這樣的一條航線，對進一步滿足兩岸之間不斷擴大的經貿往來起到了積極的推動作用。而第四條貨運航線，就是從馬尾港到日本石原轉關后運到臺灣本島的航線。這四條航線積極的促進了閩臺之間的交流與往來，這也使得馬尾港成了福建省的港口中，對臺交流航線最多，進出貨物數量最大的，也極大地促進了海西經濟區的建設與發展。