長航鳳凰于10月13日公告稱，公司預計1-9月份扣除非經常性損益后的凈利潤-24,480萬元左右，同比減少39,800萬元左右，主要是受全球性金融危機的影響，導致公司經營產量減少、運價下滑、船效下降，雖然公司采取諸多控制成本措施，但經營業績仍出現較大下滑。 
　　公司三季度繼續出現虧損，并且虧損有擴大趨勢，可能是因為燃油成本及財務費用的增加導致。數據顯示，公司7-9月實現凈利潤為-1.11億元，而公司1-6月虧損僅0.98億元。事實上，7-9月份，我國沿海散貨運價指數呈單邊上升態勢，該指數由6月底的1013點，上升至9月底的1,169點，升幅約15%，因此公司營收應較二季度有所好轉，但虧損卻進一步擴大，可能是由于第三季度我國燃油價格提高令公司經營成本上升較快，以及公司財務費用仍在持續增長中。 
　　由于江河運輸業務競爭激烈，公司江河運輸業務近年來一直虧損，盈利主要來自海運收益。數據顯示，公司08年江河運輸業務虧損約3.45億元，09年上半年繼續虧損1億元左右，嚴重拖累公司業績。而海運業務在08年金融危機之后，運價與運量迅速下降，導致公司09年上半年業績出現大幅虧損。而近期BDI指數再次回落至2,000點附近，公司海運業務盈利能力再次受到挑戰，雖然進入三季度后國內沿海散貨運輸價格有所回升，但對公司業績影響有限，公司09全年業績虧損已成定局。 
　　此外，由于公司為打造大型沿海散貨船隊，近兩年來定造大量新船，公司財務費用呈逐年增長態勢。報告顯示，公司09年新增投資項目1,500萬元、跨年在建船舶項目12.39億元和長期租賃船舶項目6.95億元，主要用于運力購置、船舶技改、設備更新、信息化以及基本建設等項目，預計09年可新增船舶33艘、運力共計48萬載重噸左右。雖然運力大幅擴張有利于公司在航運業回暖時業績迅速增長，但近期過多的投資建造新船，使得公司銀行貸款不斷增加，公司09年上半年的資產負債率已達到77.2%，公司財務壓力開始顯現。 
　　公司主要從事沿海內河干散貨業務，設有30多家分支機構，建立了輻射長江流域和南北沿海的攬貨網絡及中轉配送服務體系，是唯一能滿足長江沿線大客戶，時效強、批量大、批次多、運距長，裝卸機械化程度高的運輸需求的企業。目前，公司擁有總運力約250萬噸，長江運力約180萬噸。公司2009年中期報告顯示，公司上半年完成貨運量3,115萬噸，同比下降18.88%；貨運周轉量207.27億噸千米，同比下降21.26%；營業收入87,342.68萬元，同比下降38.11%。 
　　公司08年新下的造船訂單中，遠洋運力、沿海運力與內河運力分別為105.76萬載重噸、20萬載重噸和23.1萬載重噸，并且全部運力預計在2011年前全部釋放。公司大量增加遠洋運力，主要是為配合公司“江海聯動”優勢，實現遠洋－沿海－內河完整的水上運輸鏈，將有效提高公司整體競爭實力，但如果國際航運市場在2011年后供過于求的現象沒有改變的話，將增加公司經營難度。 
　　此外，公司參股的武大有機硅材正積極爭取上市，投資400萬元（為第二大股東）聯合武漢大學、清華紫光等發起人聯合發起設立湖北武大有機硅新材料股份有限公司成立了有機硅化合物及材料工程研究中心，在國內處于領先地位。目前公司已完成上市輔導工作正積極爭取上市，正向國內最大的精細有機硅新材料企業邁進。