雖然今年以來上港集團的集裝箱吞吐量連續三個季度環比上升，但公司方面預計全年集裝箱吞吐量同比將下降約12%。這是上港集團近年來集裝箱吞吐量首次出現下滑。  　　在剛剛過去的10月份，上港集團的集裝箱吞吐量環比和同比都有所下降，僅為217萬標箱。上港集團政策研究室經理石徑存表示，歷年來的數據顯示，公司下半年每月的集裝箱吞吐量基本保持均衡，因此預計到年底不會有太大的起色，公司全年集裝箱吞吐量同比下滑已成定局，下滑幅度約為12%。石徑存認為，外貿出口復蘇乏力，而上港集團以進出口運輸為主，這是導致上港集團全年集裝箱吞吐量減少的主要原因。由于上港集團主業集中，因此從集裝箱吞吐量的變化上基本可以推斷出上港集團全年的業績情況。
　　不過，石徑存透露，上港集團目前正在加大力度整合長江流域的物流資產，擬將重慶港、武漢港、南京港等地的物流資產整合起來，改變目前各自為政的狀態。預計在今年底或明年初將成立一家“長江公司”，以“長江公司”為平臺來統一運作長江流域的物流資產，提高經營效率。另外，上海港與寧波港的合作也一直在接洽中，具體的合作方式還沒有確定，目前最有可能的是雙方成立一家合資經營公司。
　　據石徑存介紹，上海國際航運中心建設的優惠政策已經明確，上海將對注冊在洋山保稅港區內的航運企業從事國際航運業務取得的收入和倉儲、物流等服務企業從事貨物運輸、倉儲、裝卸搬運業務取得的收入，免征營業稅，還有啟運港退稅。一旦這些政策正式實施，將對上港集團的經營業績產生積極影響。