受金融危機的直接影響，深圳市鹽田港股份有限公司（深圳交易所代碼：000088，下稱鹽田港）2008年完成集裝箱吞吐量968.35萬標箱，同比下降3.30%。這是自1989年開港以來鹽田港區集裝箱吞吐量首次出現負增長。
　　鹽田區區長袁寶成在2009年政府工作報告中指出，在鹽田港區集裝箱吞吐量下降的影響下，港口物流業發展速度明顯放緩。
　　鹽田國際集裝箱碼頭是目前中國內地遠洋集裝箱班輪密度最高的單體碼頭，2007年吞吐量突破1000萬標箱。由于大部分出口歐美（占比90%），鹽田港受全球金融危機的影響明顯。早在2008年年初，鹽田港集裝箱吞吐量便出現下滑。
　　值得注意的是，相比2008年上半年同比5.30%的降幅，鹽田港2008年全年集裝箱吞吐量下降3.30%的幅度顯然有所縮小。申銀萬國指出，這是由于鹽田港下半年開始大力開展以前較少的空箱和中轉業務。
　　另據申銀萬國研究報告，2009年1月，鹽田港區集裝箱吞吐量同比下降4%，環比下降10%以上。
　　此前，深圳赤灣港航股份有限公司（深圳交易所代碼：200022）公布的數據顯示，2009年1月共完成貨物吞吐量404.90萬噸，同比減少27.30%。