據臺灣媒體報道，臺“交通部”表示：兩岸開放大三通之后，海運直航較以往透過第三地中轉及島外航運中心的運作方式，船舶往來增長了26.42%，目前參與兩岸海運業務的船只共107艘。其中，島內共21艘，大陸19艘，權宜船67艘。 
　　據報道，在兩岸運量部分，客運目前仍處在試探階段，僅部分國際郵輪采項目申請方式，搭載大陸安利公司員工來臺旅游。今年度預定�？颗_灣的國際郵輪目前累計約64航次，比去年增長了42%，增加了19航次。貨物運輸部分，直航之后，兩岸貨柜裝卸達到16.3萬TEU，總裝卸貨量達到332萬公噸。

　　不過受到世界性不景氣的影響，全球前15大貨柜港，只有天津港維持增長，其它都呈現衰退，平均衰退幅度約9.5%，臺灣的高雄港衰退幅度約10.59%，其它港口衰退幅度多半在11%~19%之間，高雄港在衰退排行榜上位居第七，并非衰退最嚴重的港口。“交通部”表示：兩岸三通幫助島內海運業者，減少金融海嘯的沖擊。