相比大陸其他已經設立的保稅港，申報中的福州保稅港距臺灣地區最近，具有先天的對臺優勢，并且是大陸唯一區內設有鐵路的保稅港。
“我們采取邊報批、邊建設、邊招商、邊管理的方式，爭取福州保稅港區在今年上半年獲批�！备Ｖ荼６悈^人士說
按照規劃，福州保稅港區面積9.2平方公里，分為商貿配送區、國際加工區、臨港物流區、鐵路物流區和港口集散區五個區域，由福州保稅物流園區、鐵路物流園區、福清出口加工區及福州江陰港區1#至9#碼頭整合組成。
.“福州保稅區海關已于今年1月下移江陰，統一監管福州保稅物流園區、福州港江陰港區和福清出口加工區三個區域，改變了此前這三個區域分別由三個海關監管的繁瑣現象�！鄙鲜鋈耸糠Q，這三個區域雖然在地理位置上相連，但功能不齊全，整合為福州保稅港區，將實現區港聯動、政策疊加，有利于統一基礎設施配套和產業布局，實現港口、航運、物流和產業的聯動發展。
　“臺灣地區的基隆港屬于自由貿易港區，福州只有建成為保稅港區，才能在政策功能和性質上與之更為接近，實現雙方實質性對接�！鄙鲜鋈耸勘硎荆�“目前福州保稅區管委會已向有關部門申報對接，臺灣方面也表示將向相關主管部門上報�！� 
由此，待雙方主管部門批準后，雙方將可先采取“包船”的方式，對往來貨物先以個案處理再到常態化運作，并通過互設辦事機構，實施“直通關”模式。
“發展福州與臺灣兩地經貿和物流的戰略聯盟，內陸巨大的經濟發展潛力將為兩岸現代物流業提供強有力支撐，臺灣地區可以將福州作為跳板，進一步拓寬市場腹地，延伸產業鏈條�！备Ｖ菔懈笔虚L、福州保稅區管委會主任陳為民認為。
　 根據福州保稅區經濟發展局提供的資料，福州保稅物流園區一期已于去年7月2日封關運作，冠捷電子、華映光電、清祿鞋業等臺資企業，都將外地運作的“一日游”業務拉回園區運作，報備及新注資的企業，亦有10多家。
隨著保稅港的報批，愛普生電子、東北理光、三協精機等企業，也在積極籌備進區運作。
更重要的是，5月19日，福州保稅區管委會與臺灣資訊通科技股份有限公司簽署了合作協議，建設閩臺兩岸港口通關和其他作業信息對接個性化平臺系統。屆時，兩岸保稅港區將逐步實現無紙化通關。
陳為民亦指出，要盡快實現兩地電子口岸平臺的對接，在海關、稅務、商檢等方面，探索統一的信息標準化道路。
陳承茂認為，雙方建立戰略聯盟，在大陸的臺資企業成本將隨之下降，并為兩地港口開拓新的貨源，實現“臺灣接單、福州加工”和“臺灣開單、福州提貨”等新形式的合作。
根據規劃，福州市保稅港將開設“兩馬（馬祖與馬尾）三通”物流中心，以此實現臺灣本島─馬祖─馬尾保稅區─內地的雙向貨物直航。在貨運快遞配送方面，開展兩馬航線包裹業務，引入快件通關管理系統，對屬于非貿和郵遞物品性質的快件實行有別于一般貿易的快速通關。