據巴基斯坦《每日時報》5月1日報道，巴基斯坦航空公司2009年1-3月共虧損20億盧比（約合2500萬美元），與比去年同期相比減虧38億盧比（約合4750萬美元）。 
　　造成虧損的主要原因是巴航需支付昂貴的財務成本，其中2009年首季僅貸款和采購項下的匯兌損失就高達18億盧比（約合2250萬美元）。 
　　受油價回落和盧比匯率趨穩等因素的鼓勵，巴航稱其有望實現2009年贏利5.98億盧比(約合747.5萬美元)的經營目標。但目前企業內部管理問題和外航的迅速擴張使巴航扭虧為盈的任務變得更為艱巨。 
　　截至2009年3月，巴航累計虧損720億盧比（約合9億美元），但政府對此迄未出臺任何扶持措施。