香港快運航空旗下股東就公司未來發展路向雖然分歧嚴重，不過在申請貨運牌照一事上終于取得進展。有消息指，有關申請將于本周內刊登憲報。不過，原定在9月開辦香港至盧森堡和阿布扎比的貨運航線的計劃似乎仍需無限期押后。 
該公司原打算在9月18日開辦由香港至盧森堡和阿布扎比的貨運航線，并向中華航空濕租1架波音747-400貨機，而民航處為此已批出為期3個月的臨時包機準許。該貨機目前可以包機形式提供服務，但由于仍未有航權，所以不能在抵達目的地后裝卸貨物，亦不能提供常規航班。 
包機形式提供服務 
香港快運是在3月初正式向空運牌照局申請貨運牌照，并曾于4月1日召開股東大會討論。不過會上有股東認為，有關濕租波音747貨機的建議書說服力不足，反映部分管理層對有關市場理解未夠深入。 
作為股東之一的謝天賜早前曾去信該局，反對開辦有關航線，而有關牌照申請亦因此自動取消。但香港快運其后再次提出申請，預計將于本周內將正式刊登憲報。 
該航線經營權由香港快運持有，華航則經銷部分機位。據消息透露，股東反對香港快運開辦有關航線，理據在于目前香港至中歐和中東地區的貨運航線運力出現過剩，通往阿布扎比的貨運航線市場亦遠比迪拜小。假如執意開辦新航線，可能會令公司加重負債，往后亦無法提供穩定的貨運航班服務。另方面，華航亦已表明，假如香港快運最終無法提供常規貨運航班，將無意就有關計劃繼續合作。香港快運虧損額逐年擴大，06年虧損1.4億元，07年為4.4億元，08年則為5.1億元。面對連年虧損，股東對公司發展路向出現分歧，有股東認為香港快運應縮減規模，盡力減少開支，而非開辦貨運業務。