自2009年8月31日起，國航的兩岸客運航班將由平日常態化包機改為定期航班。屆時，國航經營的兩岸航線將增加到6條，即：北京—臺北桃園、上海浦東—臺北桃園、成都—臺北桃園、重慶—臺北桃園、杭州—臺北桃園、天津—臺北桃園，計劃每周執行27個往返班次。 
　　據了解，8月初，國航臺灣辦事處收到臺灣“經濟部”的核準函，8月13日，臺灣“民航局”向國航臺灣辦事處頒發了營業執照——分公司設立運行許可證。自此，國航臺灣分公司正式成立，國航成為首批獲得臺灣地區經營執照并投入運營的大陸企業之一。按照臺灣方面的規定，分公司可在當地進行營銷活動，而辦事處是不能從事任何營業行為的。
　　國航這次開通兩岸定期航班將在北京、上海、杭州等重點城市濃墨重彩，加大運力投入，將北京—桃園航線增至每天一班、上海—桃園航線增至每周六班、杭州—桃園航線增至每周五班。此外，國航還新增了成都—桃園的定期航班，以方便祖國大陸西部地區和臺灣地區的溝通和交流。重慶—桃園和天津—桃園航線的航班密度也有所增加。另外，除保留原有特色的彩繪飛機以及空客340、330等機型外，國航還將投入波音777等寬體客機執行兩岸航線，以滿足不斷增長的市場需求。國航將不斷提高服務品質，為兩岸旅客提供更加豐富的產品和滿意的服務。
　　目前，國航在臺灣地區已正式開通服務熱線電話：+886-2-27182100 ，并使用中英文解答旅客詢問。旅客也可以通過傳真垂詢：+886-2-27181900