重慶保稅區開發管理有限公司副總經理黃曲在與重慶企業交流會上披露，重慶寸灘保稅港區的功能和有關稅收、外匯政策按國務院批準要求，比照上海洋山保稅港區實行優惠政策。保稅港區對首批入駐企業實行半年免租、2年優惠等地方性優惠政策即將出臺。 
重慶海關監管通關處處長周俊解釋，在稅收方面凡國內貨物進入保稅港區視同出口，實行退稅。比如重慶渝北區2.37平方公里的兩路保稅港區圍網封關后，重慶空港工業園區的貨物進入到保稅港區，就可以享受退稅政策。對于國外貨物進入保稅港區保稅，海關暫緩征收貨物進口關稅、增值稅和消費稅等稅費等。如美國、日本、印度等國外貨物通過航空運到保稅港區，不論貨物量的多少，都保留稅收征收權，暫不征稅。而保稅港區區內貨物進入國內銷售，則按貨物進口的有關規定辦理報關手續，并按貨物出境出關的實際狀態征稅。 
若貨物是一次性進入保稅港區，而分10次或20次運輸出區，其稅收也按其實際狀態10次或20次征收，企業納稅時間縮短、資金調度成本降低、并可獲取國內外市場價差機會。此外，保稅港區圍網范圍內的企業之間的貨物交易不征收增值稅和消費稅。保稅港區內實行24小時監管通關，長假可預約通關，分送集報，并可根據企業誠信度分類通關提供快捷服務。 
保稅區管委會主任包子川表示，重慶保稅港與全國其它11個保稅港區所不同的不僅僅是「水港+空港」的一區雙功能保稅港，同時也是離地方中央商務區最近的保稅港區，國家對保稅區規定的特殊監管優惠政策、西部大開發優惠政策、重慶直轄市優惠政策和重慶兩路保稅港1期今年年底將達到封關預驗收條件，具備保稅港區基本運行條件。