國際航空運輸協會（I鄄ATA）發布報告稱，行業預期第二代生物燃料將在2012年開始正式商用，在2040年其比例將達到總燃料的50%。生物能源作為航空業的新曙光，將可以解決行業所面臨的石油燃料價格波動難題，同時減少行業碳排放。 　　國際航協指出，第二代航空生物燃料必須是可以直接替代傳統的航空煤油（JetA和JetA-1），不會影響現有品質，重點是不需要制造商重新設計引擎或飛機，航空公司和機場無需開發新的燃料運輸系統。此外，考慮環境的可持續發展，國際航協要求生物燃料的原料種植不需要砍伐森林或破壞環境，如導致生物多樣性的喪失，同時不會影響糧食生產和淡水資源，并在其整個生命周期可以減少碳排放。
　　參考其他行業的經驗和相應研究，可利用于航空運輸業的第二代生物燃料來源包括：麻風樹、亞麻薺、藻類、鹽生植物等。這些燃料將會更加環保、更加廉價，更重要的是不會像第一代生物燃料一樣，產生如“與糧爭地”、“與人爭食”等現象，第一代生物燃料主要來源有玉米、小麥等。例如，亞麻薺僅需要較少的水分和養料，就可生產高油量，可以大面積地在半干旱地區或農業貧瘠用地上種植。
　　報告指出，行業原計劃在2013年完成第二代生物燃料安全性的測試，最新的資料顯示最快將于2011年完成。同時，一些航空公司已進行了混合燃料的試飛，如新西蘭航空公司的試飛使用了來源于麻風樹的燃油，美國大陸航空公司使用了麻風樹和藻類混合燃油，日本航空公司使用來源于麻風樹、藻類和亞麻薺的混合燃油。生物燃料將會在2012年開始正式應用于航空運輸業，不高于總燃料的1%，2015年占1%，并且會逐年遞增，在2040年占50%。一些航空公司預計，到2025年總燃料的25%采用生物燃料，到2030年增至30%。
　　目前，全球航空運輸業每年消耗15億至17億桶的航空煤油，2008年的航油支出更高達1650億美元。報告指出，只要航空業燃料中的1%采用生物燃料，將可以維持生物燃料市場。生物燃料產業將可以為發展中國家等提供機會與經濟利益，發展生物燃料產業，在無法種植糧食作物的土地種植第二代生物燃料作物。
　　為了應對氣候變化問題，國際航協承諾，全球航空業將會在2020年實現碳中和增長，2050年的行業排放將比2005年減少50%。在2008年，全球航空運輸業排放了6.77億噸的二氧化碳，占全球人類排放的2%；今年全球航空業將可以減排7%，其中5%是緣于經濟危機造成的運力下降，另2%是減排策略的成效。