2009年8月31日10時50分，東航一架空客340-600飛機載著120名旅客從上海浦東機場起飛，前往臺北桃園機場。這架航班號為MU5007的班機是上海地區首架客機腹艙帶貨的兩岸定期航班。（此前9時30分起飛的上航航班仍為包機性質。） 
　　兩岸定期航班開通后，東航每周將有33個直航航班往返于大陸和臺灣之間，其中上海往返臺北每周10班。此外，東航部分分子公司所在地如南京、昆明、西安、武漢、寧波、合肥、南昌、青島等地每周也有定期航班飛往臺灣。旅客通過東航的航線網絡和便捷的“一票到底、行李直掛”等中轉服務，隨時隨刻都可輕松往來于大陸和臺灣之間。同時，上海航空每周將有7個定期航班，東航代理的華航和華信每周有15個定期航班。
　　據了解，從2008年7月4日兩岸周末包機首航至今，東航兩岸包機的平均載客率近八成。業內人士指出，首班定期航班客座率不高的原因是因為風災造成團隊旅客銳減，但這并不能真實反映兩岸航空客運市場的現狀。目前東航從上海出發的兩岸定期航班，逢周五、周六、周日，客票銷售率有時可達八成以上。這一數據充分表明了兩岸航空客運市場前景巨大，兩岸民眾對未來海峽兩岸攜手共進、共謀發展充滿信心。