新建、擴建集裝箱碼頭，土地價格予以優惠；新開辟航線給予補貼；通過優化措施加快集裝箱通關速度――
　　9月16日，市政府下發加快集裝箱運輸發展的若干意見，這是南通港口史上政府支持補貼力度最大的政策“組合拳”，業內人士認為，它必將對我市集裝箱發展產生積極而深遠影響。
　　集裝箱運輸作為一種先進的運輸方式，是港口城市開放型經濟發展的重要標志，也是相關物流業發展的集聚點。南通港自1984年開辟集裝箱運輸以來，箱量一度占據長江港口首位。但近年來，集裝箱發展步伐明顯放緩，2008年全港僅完成44萬標箱，與億噸大港的地位極不相稱。
　　當前，江蘇沿海開發上升為國家戰略，作為長江沿岸唯一同時擁有“黃金水道”和“黃金海岸”的港口城市，南通集裝箱運輸迎來寶貴的發展機遇。
　　想方設法留足岸線和配套用地
　　市政府文件規定，要加強基礎設施建設，擴大集裝箱運輸的發展空間。按照“深水深用、淺水淺用”和節約利用的原則，在通海、洋口、呂四等港區預留并加快開發港口集裝箱岸線；加強岸線使用管理，避免低層次的重復建設和惡性競爭，鼓勵、保護有序競爭，形成發展合力。在堅持科學布局、集約利用的基礎上，想方設法增加港口及配套用地，優先供應集裝箱碼頭及相關港口物流建設用地，提升港口集裝箱吞吐能力；企業在新建、擴建集裝箱碼頭時，土地價格在市級權限范圍內予以優惠。
　　財政扶持力度空前加大
　　市政府還將加大財政扶持力度，激勵企業發展。
　　對在市區新設立的集裝箱碼頭企業，投資規模在10億元以上的，從企業獲利當年度起兩年內地方稅收留成部分作為獎勵補貼企業；已設立的集裝箱碼頭企業，自今年起3年內集裝箱年吞吐量增幅超過GDP增幅的，企業所得稅增量的市、區留成部分作為獎勵補貼。
　　此外，在推出的一系列獎勵措施中，尤為引人注目的是，對已在南通港開辟的國際集裝箱班輪航線、沿海內貿直達航線，連續運行1年以上的船公司，按照航線密度、運營箱量，國際航線一次性補貼60―100萬元，沿海內貿直達航線一次性補貼30―80萬元。同時，鼓勵集裝箱碼頭企業采取“包航線”的辦法，吸引國內外船公司在南通港新開辟近洋國際航線。
　　對自今年起在南通市區注冊、納稅的貨代公司也有不少利好消息，手筆最大的是在南通港口裝卸集裝箱的，年進出口集裝箱（重箱）達到1萬標箱的，一次性獎勵10萬元。
　　通關措施優化提上日程
　　市政府還要求口岸委牽頭，研究解決港口集裝箱運輸中存在的問題，加快優化通關措施，通過實行5+2全天候工作制，進一步加快集裝箱通關速度，提高通關質量。
　　檢驗檢疫等部門將對集裝箱箱源、檢疫對象實行分類管理，除衛生除害處理規定時限外，現場檢疫查驗當天完成。海事等部門對集裝箱班輪的檢查，實行提前告知、約時檢查，在港停留少于24小時的，進出口手續合并辦理。公安、交通等部門建立集卡運輸綠色通道。相關執法部門對符合國際標準集卡不予處罰，方便集卡進出。
　　對沿海內貿直達航線和國際航線集裝箱班輪將做到隨到隨靠，及時提供拖輪服務，確保班輪準班運營。同時還鼓勵集裝箱碼頭企業運用經濟杠桿，積極吸引貨源。對在南通港首次開辟的沿海內貿直達航線和國際航線在碼頭所產生的裝卸費給予費率10%%的優惠，對中轉箱免收駁船裝卸費，對大宗貨源進口給予免堆18天的優惠。