在截至2009年12月31日的 巴拿馬運河管理局財年一季度，巴拿馬運河過船量增加了2%。通過運河的船舶從一年前的3,520艘增長到了3,590搜。通過運河需要大量時間和較高的導航技術的巨型和大型船舶從1,874艘增長8.1%，到了2,026艘。
    就通過的船舶種類而言，干貨船和油船增加，而集裝箱船、冷藏貨船和汽車運輸船通過量下降。平均過船時間大大下降，從27.97小時下降到了20.29小時，下降幅度為27.5%。預定通過運河船舶的通過時間則從16.94小時下降到了13.43小時，下降幅度為20.7%。
    按巴拿馬運河通用測量系統(PC/UMS)計算，通過運河的船舶從7820萬PC/UMS噸增長到了8090萬PC/UMS噸，增長3.5%。每1,000艘船舶通過運河事故發生率從1.12%下降到了0.9%。通過運河預定系統的利用率已經比2008年同期的90.9%下降了52.6%，下降到了43.1%。