據報道，福州保稅港立足江陰港區臨海接近臺灣的優勢，計劃與基隆自由貿易港區建立戰略聯盟，實現兩岸海運直航，為兩地港口開拓新的貨源。為了進一步拓寬海西貨物進出通道，建構兩岸經貿合作新模式，福州市將福州保稅物流園區、鐵路物流園區、福清出口加工區及江陰港區部分的作業區功能，向國務院申報成立保稅港，目前工作順利推展。福州保稅區管會指出，未來的福州保稅港將可實現四個區域的功能綜合、政策互補、管理一體及服務聯動。借助現有的港口功能和政策等優勢，福州保稅港有望成為大陸功能最全、政策最優、開放層次最高，與國際接軌的中國特色自由貿易區之一。