隨著運輸業務量的快速發展，南寧吳圩國際機場貨郵吞吐量得到飛速增長，貨運站貨物處理區可供使用面積僅為1500平方米，計算最大吞吐能力為1.6萬噸/年，貨運站面積過小帶來的各種矛盾日益加劇，無法滿足正常使用要求。為確保在新航站區貨運新區建成之前，現貨運站能適應運輸生產發展的要求，機場公司投資1366.5萬元，對現貨運站向北擴建2928平方米，其中貨運倉庫2414平方米，業務用房及其他514平方米；配套建設停車場、貨物堆放場、道路共計3000平方米及室外給排水、供電、消防、綠化等設施；購置貨檢X光機、叉車、貨架、地磅等設備。在經過7個多月的建設工期后，現貨運站擴建工程已完工，于2010年7月23日通過了驗收并投入使用。應急擴建后的貨運站，無論是規模還是功能設施都可以滿足機場航站區搬遷的過渡期運輸生產的需要，為機場生產發展提供硬件支持。