作為中國南部沿海唯一保稅物流體系——廣西北部灣經濟區保稅物流體系正加快建設，以推動中國－東盟自貿區發展走向縱深。
２０１０年１１月２６日，國務院正式批準欽州港口岸擴大對外開放，同意欽州港口岸西港區和中港區對外國籍船舶開放，長２８．７７６千米的岸線，９８個泊位擴大對外開放。１２月８日，廣西欽州保稅港區首批５個入區項目同時舉行開工儀式，這意味著中國距東盟最近的保稅港區進入全面開港運營進程。與此同時，廣西憑祥綜合保稅區的建設也在如火如荼地進行。 
至此，南寧保稅物流中心與欽州保稅港區、憑祥綜合保稅區和北海出口加工區拓展的保稅物流功能一起，構建起較為完善的廣西北部灣經濟區保稅物流體系，成為聯系中國西南地區和東南亞國家的核心樞紐以及連接海港、空港和邊境口岸的大型物流商貿基地。 
向著現代物流發展的廣西北部灣經濟區保稅物流體系，其運作模式是以北海出口加工區、欽州保稅港區、憑祥綜合保稅區等為沿海沿邊節點，通過南寧保稅物流中心這一核心樞紐直接為西南地區乃至東盟國家的企業提供保稅物流服務。 
廣西北部灣經濟區管委會常務副主任陳瑞賢介紹說，北部灣保稅物流體系具備了碼頭作業、保稅物流、出口加工等目前對外開放區域中的所有功能，將形成企業國際業務、系列優惠政策、生產要素等多方面的“集聚效應”。伴隨著區域內公路、鐵路等交通網絡建設的日趨完善，將顯現出在整個區域發展及中國－東盟經貿合作方面的強大推動效應。 
作為對接東盟的前沿，廣西北部灣經濟區保稅物流體系一直在泛北部灣合作中發揮著重要的作用。在各方努力下，泛北部灣合作一直在穩步推進之中，而隨著欽州保稅港區、深圳前海灣保稅港區、廣州南沙保稅港區、憑祥綜合保稅區等多個保稅區的建立和運行，在泛北部灣經濟區內一個功能齊全、完善的綜合保稅物流體系正在加速成型。