新世紀以來，南通狠抓產業結構轉型，轉變發展方式，一方面紡織等傳統產業提檔升級，增強了競爭力；另一方面海洋工程、新能源、新材料、生物醫藥、智能裝備、節能環保、軟件和服務外包等新興產業迅猛發展，工業結構不斷優化，實現歷史性跨越。
依托中遠船務、熔盛重工、明德重工等骨干企業，我市海洋工程產業位居全國第二，占全國海洋工程市場1/3份額；韓華新能源、歐貝黎新能源、強生光電等光伏企業和明陽風電等一批新能源企業具有較強的競爭優勢，帶動起一批產業鏈上下游科技企業；神馬科技成為全球唯一能夠向電網提供全系列復合絕緣子的廠家，中天科技在國內光纖行業名列前茅，新材料產業培育了一批擁有核心技術和拳頭產品的龍頭企業……戰略性新興產業風生水起，與傳統產業攜手發力，正成為南通打造長三角北翼經濟中心的新引擎。
如果把紡織、船舶等傳統產業比作經濟發展的“原核”；海工、新能源等新興產業就是加速運轉的“新核”，從“原核”單跳變為“雙核”齊跑，南通的經濟轉型之路走得更為順暢、穩健、后勁十足。