近日，南沙保稅港區信息系統正式上線啟動，標志著保稅港區的管理實現一體化、智能化的大飛躍。據悉，廣州海關以2008《海關總署廣東省人民政府關于建立署省緊密合作機制的合作備忘錄》在廣州簽署為契機，兩年多來落實合作備忘錄中支持促進海關特殊監管區域和保稅監管場所建設與發展，使保稅物流成為廣州加快經濟發展方式轉變、引領現代服務業發展的重要抓手。
廣州南沙保稅港區于2008年10月18日批復設立，是我國批準設立的第九個保稅港區。為促進保稅港區經濟發展，用好國家賦予南沙保稅港區的優惠政策，廣州海關積極開展海關支持區域物流發展課題研究，探索促進特殊區域可持續發展道路，不斷增強特殊區域發展動力。采用參加政策推介會、召開政策說明會、企業座談會等形式，支持政府招商引資。同時制定特殊監管區域和場所的政策匯編和企業指南，使政府、企業充分掌握各類保稅物流載體的有關政策、規定，提高海關執法透明度。
廣州海關致力于優化海關監管模式，開發“廣州海關特殊區域和保稅場所監管系統”，實行集中報關、網上備案、以柜代倉、電子轉關等高效便捷措施。開展分撥、配送、轉口等新型業務，為企業提供個性化服務。統籌港口作業、保稅加工、倉儲物流業務，實現保稅物流和保稅加工管理的無縫對接。簡化作業流程，做到“一次申報、一次查驗、一次放行”。實施協管員管理模式，解決海關人力不足與日益增長的業務量之間的矛盾，提高通關速度，實現貨物全天候進出。海關的一系列便捷措施吸引大批企業進駐，廣東合捷、沙伯基礎創新、出光塑料、日立工機等15家大型物流、生產企業先后落戶南沙港區。據海關統計，2010年1月至11月，南沙保稅港區保稅貨物進出區貨值合計5.66億美元。
廣州空港保稅物流中心（Ｂ型）運作后，廣州海關積極對入駐中心企業開展政策指導，及時制定完善廣州空港保稅物流中心海關操作規程和企業辦事指南，確保物流中心運作順暢，同時以“封閉化、智能化、信息化、規范化”為原則，以信息系統為依托，探索建立“空港口岸-保稅物流中心”無縫對接一體化運作新型管理模式，促進保稅物流與口岸物流的有效聯動。
空港保稅物流中心（Ｂ型）依托大珠三角的區位優勢和廣州空港的國際樞紐作用，發揮其保稅倉儲、保稅物流、國際中轉、國際配送、國際采購等功能作用。特別是通過“入中心即退稅”等政策優勢的吸引，打造便捷的通關環境，降低物流成本，不少珠三角企業紛至沓來。目前有3家物流企業進駐，有３０多家企業有入駐意向，據統計，截至2010年11月30日，空港保稅物流中心共進出貨物重734.46噸，貨值約145.5萬美元。