近年來，北京市轉化奧運食品安全保障成果，積極建立和完善食品安全三大體系，食品安全總體水平穩步提高。1998年，全市食品安全的總體合格率為79.8%；經過多年努力，2010年達到97.36%，呈穩步上升趨勢。
近年來，北京整合政府各部門的監督抽檢工作，以市食品安全監控中心為基礎，制定年度全市統一監測和抽檢計劃，對65大類食品開展監測和風險評估，年均檢測樣本10萬個。初步形成了“政府監督抽查、第三方委托檢驗、企業自檢”三位一體的首都食品安全監測體系。243家食品批發市場、連鎖商場、超市建立了食品檢測室。
以北京市企業信用信息系統為平臺，完善信用征集、評價、披露和獎懲制度，2003年至今，共將4919種危害較大的不合格食品和56家屢出問題的食品生產企業以及7個地區的產品清退出首都市場，并錄入北京市企業信用信息系統，形成品種退市、企業退市和產區退市的懲戒機制。
此外，北京市還大力推進食品產業和市場升級改造。市、區政府扶持并拉動社會各界投資累計達22.8億元，對561個農副產品市場、207個社區菜市場實施了升級改造，制定出臺了農副產品批發市場和社區菜市場的地方標準，實現了封閉冷藏運輸和冷藏銷售。在遠郊區縣，全市累計建設村鎮食品連鎖超市4175家、社區食品便利店2300余家和安全豬肉專柜等網點5000多家，并設立92家農藥連鎖經營配送站點，指導建立專業化農產品物流配送公司474家。