1997年，為加強上海國際航運中心建設，國務院同意上海組合港的組建方案。上海組合港以上海為中心，浙江和江蘇為兩翼，在不改變原有地域和行政隸屬關系的前提下，對相應港口的集裝箱碼頭泊位進行組合。1997年9月29日，上海組合港管理委員會（上海組合港管委會）正式成立。 
　　成績斐然
　　15年來，上海組合港建設取得巨大成就：主要航道得到整治，專業化碼頭陸續建成，航運集疏運體系不斷完善，物流服務效率不斷提高，航運服務功能不斷健全，港口通過能力快速增長。
　　據上海組合港管委會辦公室主任王明志介紹，2011年長三角港口完成貨物吞吐量37.57億噸，占全國比重的37.42%，是1997年的6.12倍；集裝箱運輸發展成果顯著，已與世界180多個國家和地區開辟了900多條航線，每天有240多個航班往來，完成集裝箱吞吐量6180.49萬TEU，占全國比重的37.69%，是1997年的19.31倍。目前，長三角港口生產用碼頭泊位數15478個，占全國48%。其中，上海2343個；浙江省5896個；江蘇7239個。
　　目前，長三角地區已有上海港、寧波-舟山港、湖州港、嘉興內河港、蘇州港、南通港、南京港、連云港港、江陰港、鎮江港和泰州港十一個億噸大港，其中，上海港和寧波－舟山港在世界10大集裝箱港口中，集裝箱吞吐量比重由1996年的4.9%提高到23.8%。2011年，上海港完成集裝箱吞吐量3173.9萬TEU，連續兩年位居世界第一。
　　根據“立足長江、面向世界、打造現代化國際海港區”戰略目標，長江口深水航道治理三期工程勝利完工并交付使用，長江口航道水深由-7米增深至-12.5米。2011年8月28日，南京以下12.5米深水航道建設也已開工。
　　此外，在發展高端航運服務業、航運金融、郵輪產業等方面，長三角地區也走在了前面，國際航運綜合試驗區政策效應初步顯現。2011年底，中國海事局批復設立新的船籍港“中國洋山港”，洋山保稅港區船舶登記工作取得實質性進展；國際貿易結算中心外匯管理試點正式啟動，期貨保稅交割業務取得突破，航運產業基金初步組建；上海航運交易所編制“上海出口集裝箱運價指數”，國內基于此指數的衍生品交易額超過100億人民幣……
　　“十一五”期間，在國務院關于《長江三角洲地區區域規劃》和《關于加快長江等內河水運發展的意見》等政策的指引下，長三角地區建立推進上�！皟蓚�中心”建設的部際協調機制，上海組合港港航工作會議機制作用進一步發揮。建立了長三角地區和中部六省市以及川渝滬等區域“大通關”合作工作機制，促進跨區域口岸物流聯動發展，增強了地區間港航業深度合作，建立長三角港口間更為高效、便捷和安全的集疏運通道。
　　協調服務促進港航發展
　　上海組合港管委會自成立以來，在推進上海國際航運中心建設過程中，根據不斷變化的國內外經濟形勢、港口發展趨勢和長三角區域港口發展的需要，發揮區域港航綜合協調優勢，加強上海國際航運中心發展戰略分析和政策研究，為區域港口、航運及現代航運服務協調發展提供政策建議。與中共中央政策研究室經濟局一起開展上海國際航運中心發展調研，起草《率先建成上海國際航運中心的政策建議》專報，輔助上海國際航運中心建設決策，對國務院2009年19號文件的出臺起到一定的助推作用。
　　上海組合港管委會建立和完善了長三角區域港口規劃、市場監管、港航信息化建設和港口安全與環保四個強有力的合作協調機制和高效運行機制，確定了上海組合港港航管理部門十三項聯動工作方案，進一步明確了上海組合港工作會議的成員單位、工作重點等問題，為區域港口協調發展提供了有力支撐。
　　在金融危機期間，上海組合港管委會積極主動協調區域港口采取聯合行動，制定《長三角港口集裝箱運輸應急聯動規則》，協調各港保持價格基本穩定，有效減弱了金融危機對區域港口的沖擊，維持了市場穩定，避免了惡性競爭。
　　自成立以來，上海組合港管委會把加強信息研究整理和分析預測當作重要工作之一。從2006年起，每半年和一年分別發布《長三角地區港口經濟運行情況和形勢分析》報告，向交通運輸部，上海市、浙江省、江蘇省政府及長三角地區港口管理機構，港口、航運企業等提供比較系統、全面的區域港口經濟運行情況及形勢分析，用信息引導區域港口發展方向，引導各港健康發展。
　　上海組合港管委會十分重視區域港口信息化建設，制定《長三角區域港口信息化建設發展意見及行動方案》，促進各港信息化工作的相互銜接，建立港口行政管理和港口企業業務信息互通機制，組織構建長三角區域及長江流域港口數據交換中心，初步提出建立長三角及長江流域數據交換中心的設計方案及各港合作建立共享平臺的方式和運營模式。
　　為推進現代航運服務業發展，上海組合港管委會積極支持上海國際航運中心相關單位開展航運金融、航運法律、航運人才等活動，與中國銀行、建設銀行、上海國際航運仲裁院、上海市人才交流中心、歐盟中國經濟文化委員會等單位分別簽署戰略合作框架協議，共同推動上海國際航運中心航運金融、航運保險、航運法律、航運文化等高端服務的開展。
　　上海組合港管委會積極協助交通運輸部和兩省一市政府做好區域協調工作，參與做好長三角地區水運市場監管及應急協調任務。在防凍抗災期間，負責組織協調長三角港口搶運電煤，協助交通運輸部水運局組織上海市有關單位做好中日集裝箱運輸航線協調，規范市場行為，避免出現重大問題。
　　從務虛到務實
　　1996年，我國提出以組合港為核心的港口建設模式，沿海港口要加快資源整合，突破行政區劃界限，充分發揮港口的群體優勢。1997年9月，上海組合港管委會成立，探索以上海市為中心，江蘇省、浙江省為兩翼的港口間協調發展模式。
　　2000年，上海組合港管委會第二次全體會議提出，組合港范圍內的港口成立集裝箱碼頭建設規劃、建設項目時要征求管委會意見；希望中央審批組合港范圍內的國內外集裝箱碼頭運輸建設、中外班輪航線項目時聽取管委會意見。
　　2010年9月29日，上海組合港管委會為深入貫徹落實國務院關于加快推進上海國際航運中心建設的意見，根據上海國際航運中心建設情況和國際國內水運形勢，召開第三次全體會議，調整工作方針和工作重點，按照“掌握動態，研究問題，提出建議，支持決策，協調服務”的工作原則，確定下一步推進上海國際航運中心建設的十項重點工作。
　　2011年10月22日，上海組合港管委會為進一步發揮對推進上海國際航運中心建設的綜合行政協調作用，在第三次全體會議確定的《推進上海國際航運中心建設重點工作》的基礎上，不斷深化，召開了第四次會議，確定“十二五”期間《推進上海國際航運中心建設重點工作的行動計劃》。
　　9月26日，上海組合港管委會第五次全體會議在上海市召開。會議審議通過了《推進長三角區域港航合作的指導意見》，明確指出應加強長三角區域港口規劃協調，加強港口集疏運體系和港口綜合信息服務平臺的建設，要支持港航企業跨區域開展業務，加大航運綜合試驗區的政策創新力度。
　　隨著長三角區域一體化進程的日趨加速，上海組合港管委會成立15年來，以上海市為中心，江蘇、浙江為兩翼的港口間協調機制逐漸從務虛轉變為務實。“十二五”期間，為推進上海國際航運中心建設，組合港成員將開展十一項重點行動，招招劍指長三角一體化協調發展。
　　“十二五”期間的十一項重點行動包括：完善上海組合港辦公室工作制度，建立上海組合港規劃協商機制，促進各港規劃銜接；組織聯合研究并推進鐵水聯運發展；建立上海國際航運中心綜合信息服務平臺，逐步建立全國水運數據中心長三角分中心，發展智能航運；完善區域監管機制，規范運輸市場秩序；繼續發布港口經濟形勢分析報告，引導企業健康發展；加強港航政策研究，促進區域港口合作；優化內河集疏運體系，提高水水中轉比例；聯合研究航運金融，加快發展現代航運服務業；加強國際合作，建立高端人才培訓機構；聯合舉辦大型港航系列宣傳活動；推動建立具有世界較強影響的中國國際航運節。