今年1月1日起在上海啟動的營業(yè)稅改征增值稅試點收效似乎并不樂觀。物流行業(yè)人士判斷，相比增值稅擴圍改革以前，物流業(yè)稅負幾乎增加一倍。 
　　中國物流與采購聯(lián)合會3月21日發(fā)布的調查報告顯示，試點2個月以來，物流企業(yè)特別是運輸型物流企業(yè)普遍反映稅負大幅增加。
　　調查報告統(tǒng)計顯示，2012年1月份，67%的試點企業(yè)實際繳納增值稅有一定程度的增加，平均增加稅負5萬元。換算成營業(yè)稅體制，57%的企業(yè)稅負增加超過5萬元，24%的企業(yè)稅負增加超過10萬元，個別大型物流企業(yè)集團稅負增加超過100萬元。
　　對此，中國物流與采購聯(lián)合會副會長賀登才3月21日表示，“如果能采用最低檔的稅率，這就很好了�！�
　　根據試點方案，上海交通運輸業(yè)采用11%的增值稅稅率，代替了過去營業(yè)稅3%的稅率；而倉儲、配送和貨運代理則采用6%的增值稅稅率，代替過去營業(yè)稅5%的稅率。
　　運輸型物流企業(yè)認為，由于企業(yè)實際可抵扣項目較少，11%的增值稅稅率導致交通運輸業(yè)的稅負不減反增；相對而言，實行6%增值稅稅率的倉儲、配送和貨運代理行業(yè)在改革后稅負相對穩(wěn)定。
　　今年全國兩會期間，上海市委書記俞正聲就曾公開表示，改革試點后，運輸業(yè)和金融租賃業(yè)兩個行業(yè)的稅賦是加重的，要在相關行業(yè)探索加大進項抵扣范圍等創(chuàng)新辦法，“比如運輸企業(yè)，汽油能不能開增值稅發(fā)票，作為增值稅抵扣的內容；運輸企業(yè)的過路費，能不能進入進項抵扣的范圍，這需要企業(yè)和政府共同研究”。
　　中國物流與采購聯(lián)合會建議，將“貨物運輸服務”從“交通運輸服務”中剝離，納入“物流輔助服務”，采用6%的增值稅稅率。
　　另一個建議是，增加增值稅進項稅抵扣項目。比如過路過橋費、保險費，以及房屋租金等。對存量資產(非不動產)采取過渡性抵扣政策，允許物流企業(yè)現(xiàn)有的運輸工具及設備依據一定比例納入進項稅額抵扣。
　　目前，只允許對企業(yè)上一年購買的設備等進行抵扣，此前幾年的則不行。
　　物流行業(yè)人士指出，上述兩個建議，都可以使得物流運輸業(yè)的稅負回到稅改前水平。其中，使用較低檔稅率要簡單些。而后一項增加進項稅抵扣項目，操作起來難度稍大。
　　中國物流與采購聯(lián)合會建議，營業(yè)稅改增值稅的改革進一步推廣時，最好按行業(yè)推開，而不是按地區(qū)推進，以避免引發(fā)地區(qū)間的不平衡。
　　據悉，目前繼上海后，江蘇、浙江、安徽等地已經提出了類似上海的物流業(yè)稅改方案。中國物流與采購聯(lián)合會認為，像物流業(yè)這樣全國網絡化經營的行業(yè)，不宜因試點政策的不同，造成新的地區(qū)分割。