為使成都雙流國際機場二跑道最大限度的發揮作用，更好地為航班運營提供保障，以滿足成都雙流國際機場吞吐量日益增長的需求，國家發改委于2011年批準建設南充機場軍民合用改擴建工程，工程主要建設內容為新建一條跑道、聯絡道及停機坪等；同年，該工程經民航西南地區管理局批準了初步設計及概算。工程于2011年4月20日正式開工，經過一年半的建設，于2012年11月13日竣工。
　　為使南充機場新跑道早日投入使用，西南管理局于2012年11月30日組織相關單位對已完工的南充機場新跑道進行了行業驗收，并派四川監管局多次到南充機場進行復查，為新跑道啟用前的各項準備工作提供指導和幫助，制定了詳細的保障運行方案，以此確保轉場工作的順利進行。
　　2013年3月6日晚，通過南充機場轉場保障小組的連續不斷的緊張施工，于7日凌晨完成了各項轉場保障工作。3月7日9點32分，廣漢飛行學院PA44-3597號飛機首次在南充機場新跑道降落；10:44分，南航CZ6946號北京至南充航班順利落地，標志著南充機場新跑道正式投入運營。