2013年7月6日，韓亞航空214號班機在美國舊金山國際機場降落過程中發生事故。機上乘客和機組人員共307人，其中乘客291人。141名中國公民中3名中國學生遇難。除了這起空難，1988年成立的韓亞航空還發生過兩起空難事故。
    韓亞航空733號班機空難
    最嚴重的一起是發生在1993年7月26日。一架載有110名乘客和6名機組人員的波音737-5L9型客機，從韓國首爾金浦國際機場飛往全羅南道木浦的途中，當時的報告指能見度高，可是在空難發生前，天氣卻瞬間轉壞，并刮起強風和下大雨。該航班曾兩次嘗試著陸都未能成功，到了第三次，機長嘗試強行降落木浦機場的06跑道前，卻意外撞向離跑道4公里外Mount　Ungeo的山脊處。飛機即時爆炸起火，造成機上66名乘客及2名機組人員死亡。
    這是波音737-500第一次發生墜機事故，亦是歷來涉及737-500型客機的第二最嚴重事故，僅次于2008年9月14日發生的北俄羅斯航空821號班機空難。在當時，這亦是韓國本土史上第二傷亡最慘重的空難（韓國境內傷亡最慘重的空難是2002年4月15日的中國國際航空129號班機空難）。
    韓亞航空991號班機空難
    相對于韓亞航空733號班機空難，韓亞航空991號班機空難，由于是貨運航班，造成的人員傷亡人數則少得多。991號班機空難發生于2011年7月28日。韓國當地時間2011年7月28日凌晨2時47分，一架波音747-48EF型貨機由首爾仁川機場起飛，前往上海浦東，貨機搭載58公噸貨物，包括大批的手提電話、鋰電池、半導體、發光二極管和液晶顯示器等，余下貨物則有樹脂、油漆和其他化學品。
    4時03分，機長匯報指機艙發生火警，要求轉飛濟州并緊急降落。4時11分，航管中心與飛機失去聯系，飛機其后墜毀于濟州島以西107公里海面。機組人員與上海航管部門最后的通訊內容是“機艙起火”。機上兩名分別52和43歲的正副機長下落不明，二人飛行時數達19000小時，并有7000小時執飛波音747的經驗。
    當日4時45分，韓國海洋警察廳派遣隊伍前往搜救。6時10分，搜救隊表示只找到了小量殘余物如座椅、救生衣、有韓亞機身色彩的金屬塊和油污于海面漂浮，但飛機機體殘骸仍未尋回。8月17日，搜救隊確認了包括垂直尾翼在內的39件殘骸的位置，約于水下80米，而垂直尾翼中可能包含了飛行記錄儀和機艙對話記錄器。兩名遇難飛行員的遺體于10月29日尋獲。（隋秀勇編輯整理）