至于具體原因，相關碼頭表示不清楚。市交委港航和貨運交通管理局相關負責人稱，現在收“存在爭議”，與企業溝通后暫時不收，但“有些東西還要問國家發改委”。
國內其他碼頭均在收貨物港務費，是非常普遍、正常的，深圳港之前未收過，現在收存在爭議，目前與企業溝通后已暫時不收，也有可能再收，還在溝通———市交委港航和貨運交通管理局相關負責人。
“收”與“不收”僅相隔24天
鹽田碼頭、蛇口(本文中包括赤灣碼頭)碼頭及大鏟灣碼頭是深圳港的三大碼頭，去年12月1日，三碼頭均貼出公告，將于2016年1月1日零時起征貨物港務費。鹽田碼頭相關人員曾表示，依據是去年10月國家發改委印發的《中央涉企經營服務收費目錄清單》，清單中列明的中央涉企進出口環節經營服務收費項目包括“貨物港務費”項。不過，深圳港三大碼頭成立運營至今，一直未收取過該費用，至于原因，曾有碼頭相關人員表示因深圳為特區，碼頭有港企參與投資，而依據相關規定可以自定收費標準。
去年12月末，三大碼頭相繼貼出通知，均稱對貨物港務費“暫不收取”，但都未提及具體原因。大鏟灣碼頭一家企業也對南都記者表示，也收到了“不收貨物港務費”的口頭通知。
南都記者曾致電赤灣、鹽田碼頭，工作人員表示該費用確實暫緩征收，但并不了解具體原因。以大鏟灣碼頭為例，其12月1日發布通告要收“貨物港務費”，12月25日便又貼出通告稱“暫不收取貨物港務費”，前后相差僅24天。
港航局相關負責人：還要問發改委
市交委港航和貨運交通管理局相關負責人表示，國內其他碼頭均在收“貨物港務費”，是非常普遍、正常的，深圳港之前未收過，現在收“存在爭議”，目前與企業溝通后已暫時不收，“也有可能再收，還在溝通�！�
該負責人稱，“我們是行業主管部門，但(貨物港務費)價格是交通運輸部及國家發改委負責，問題很復雜，有歷史遺留問題，牽扯到投資、建設、服務等方面……有些東西還要問國家發改委�！�
