由于市場持續不景，臺灣民航業者近期紛紛決定停飛部分島內航線，以應對客源缺乏的窘境。  　　綜合島內媒體報道，繼春節前立榮航空公司宣布將退出“臺北－高雄”航線后，遠東航空公司日前又宣布將停飛“臺北－臺南”及“高雄－花蓮”航線，華信航空公司則將停飛“臺中－臺東”航線。 
　　根據有關機構的統計，2001年至2007年，島內航線班次平均每年減少7.6％。特別是2007年1月臺灣高速鐵路通車以后，2007年1至10月，島內航線旅客量比上年同期大幅衰退25.3％。 
　　有業者認為，如果未來1年內仍無法全面開放兩岸“三通”，或大幅增加兩岸包機航班及班次，在高鐵不斷增加班次的情況下，島內西部航線將全部失去市場，甚至連花蓮、臺東等東部航線也將告急，“到時候，航空公司已經不是合并的問題，而是倒閉”。 
　　據臺灣《中國時報》報道，出于對兩岸“三通”的期盼，島內航空業者一度大量購入飛機，但“三通”遲遲不開放加上島內航空市場不景氣，現在島內民航業境況凄慘，航空公司倒閉、合并的傳聞不斷，有的只能靠賣飛機來勉強維持營運。 
　　因經營困難，遠東航空公司最近已發生財務危機。據媒體報道，該公司短短幾天中遭到退票的支票金額累計達到3750萬元新臺幣，資金缺口相當嚴重。 
　　不僅航空公司生存困難，島內機場近幾年也是艱難度日。最新公布的統計顯示，島內現有18處民用機場中，只有桃園、高雄兩座國際機場有盈利，其他皆虧損。 
　　業者普遍認為，只有盡快全面開放兩岸“三通”，島內民航業才有可能“走出寒冬”。