７月２９日６時３０分，廈門市防汛辦和廈門氣象臺發布臺風解除警報。廈門海事局接到通知后，立即采取各項保障措施，組織在港船舶有序恢復海上交通和港口生產作業。目前，在廈門海事局的組織和指揮下，廈門港口有條不紊地恢復正常生產。雖然此次防臺期間港口水域通航密度較大，但船舶航行秩序良好，船舶疏散期間，沒有出現航道擁堵的現象，沒有發生水上險情和交通事故。 
　　針對“鳳凰”臺風過后，６１６艘在錨地和避風塢防臺的船舶集中離開的情況，廈門海事局及時發布ＶＨＦ航行警告，提醒各單位和船舶認真檢查船體、設備情況，服從船舶交管中心的統一指揮，有序進出港口，確保航行、錨泊安全；通知局屬各單位根據各自轄區情況采取措施做好恢復生產的安全監督；通過ＶＴＳ系統及時掌握船舶交通流狀況，有效組織船舶疏散，提供船舶航行信息服務；提前派出海巡艇，前往主要航道和港區、重點水域，監控和指導船舶交通流。