據福州海關人士分析，福州新港集裝箱吞吐量逆勢增長，原因有三：一是位于福州馬尾的福州保稅區海關整體搬遷至福清江陰的福州新港，充實加強了新港通關監管力量；提前報關、快速轉關、上門驗放、擔保驗放和預約通關、延時通關、加急通關等一系列服務新舉措，確保通關二十四小時暢通，加快了貨物通關速度。 
　　二是福州海關著力優化通關環境，提高通關質量，吸引了許多國際海運巨頭紛紛投資新港開辟新航線。上半年，福州新港新添美西、東南亞與歐洲三條國際集裝箱班輪航線，從而形成了由歐地、歐洲、中東、西非、美西遠洋航線和韓國線、東南亞線、香港線、臺灣線及內支、內貿線的密集航線網絡。
　　三是簡化進口空箱監管手續，減少港內倒箱程序，降低物流企業成本；允許從事海運船舶同時裝載內外貿集裝箱貨物，提高物流企業運輸效益；將新航線船舶辦理進出港監管手續提前，提高泊位使用效率；對可再生資源等新港大宗進口貨源提供“門對門”驗放服務，支持新港建成可再生資源物流中心；推動新港與保稅物流園開展區港聯動，借助保稅物流園區政策優勢吸引大宗物流集聚。