6月9日，交通運輸部對外發布2009年第20號公告，要求從6月15日起在全國范圍內實施國際集裝箱班輪運價備案制度，過渡期45天，至7月31日屆滿。7月31日，交通運輸部在上海召開實施國際集裝箱班輪運價備案制度工作會，宣布在上海航交所設立“國際集裝箱班輪運價備案中心”，上海航交所成為交通運輸部指定的唯一的專門運價備案受理機構。 　　過渡期運行良好
　　從6月15日開始的國際集裝箱運價備案制度（簡稱“運價備案”）從原先的兩省一市覆蓋到全國。7月1日，中遠集運向上海航交所備案了其公布運價，成為《公告》后首家備案運價的船公司。
　　截至6月底，交通運輸部頒發的班輪運輸許可證共計161家，其中從事國際集裝箱班輪運輸的公司153家。在持有許可證的153家國際班輪公司中，有40家已經停止運營或不在備案范圍，應備案的國際班輪公司為113家。有19家雖然持有許可證，但通過控股公司統一備案。截至7月30日24：00時，97家班輪公司履行了《公告》的要求，實施了運價備案，占應備案國際班輪公司的85.8％；進入上海航交所運價備案數據庫的公布運價為22420條，協議運價為65655條。
　　自1996年成立以來，上海航交所在交通運輸部領導下，受理長三角兩省一市的運價備案，迄今已有13年的經驗。在此次推動運價備案體系向全國范圍推進時，上海航交所隨即開展了一系列工作。
　　規范操作，制定備案指南。上海航交所在多年受理備案的基礎上，結合此次《公告》要求，推出了《運價備案操作指南》，對備案程序、備案代碼規則、填表規則等做出了細致說明。
　　升級系統，完善報送體系。上海航交所擯棄了原有的紙質報送方式，全面改用電子報送體系，并運用信息加密上傳技術，滿足了國際班輪公司加密信息的傳輸要求。同時，完善了運價備案的檢查、分析和統計等功能，為今后政府加強市場監管提供了一定的條件。
　　開展培訓，加強溝通交流。為更好地服務于各班輪公司，規范具體操作，上海航交所于6月19日、7月30日，分別在上海和深圳舉辦了兩期運價備案操作培訓班，共有57家班輪公司、14家船舶代理公司的116名相關人員參加了培訓。上海航交所也由此建立了備案專業人員名錄，為建立全國性運價信息網絡打下了良好基礎。
　　作為交通運輸部指定的專門運價備案受理機構和全國范圍運價備案制度實施進程中的一個服務環節，在此次工作會議上，上海航交所總裁張頁代表上海航交所承諾將堅持“保密、服務、公平”三項原則，保守班輪公司商業秘密，為航運市場服務，為交通運輸部實施監管把好第一關。
　　狙擊“負運價”
　　交通運輸部水運局局長宋德星在會上指出，“在金融危機下，交通運輸部將按照國家‘保增長、促內需、調結構’的指導方針，按照努力提高政府服務能力和水平的總體要求，維護市場秩序，幫助企業樹立信心、支持企業抱團取暖、鼓勵企業合作共贏�！�
　　宋德星認為，“越是困難的時候，就越是考驗航運的文化。我們的文化應該是積極向上的�！彼�說，在當前的嚴峻航運形勢下，出現了部分企業為了取得貨源惡性殺價的情況，以低于正常合理的運價攬取貨物。這種采取價格傾銷的惡性競爭現象，已經不是出現在某個航線，在中美和中歐的主干航線也有出現�！斑@種惡性競爭的局面，對國際班輪運輸市場信心的恢復是不利的，也不利于我國班輪運輸健康有序發展，也不利于為我國經濟貿易提供穩定可靠的運輸保障。”
　　為了構建和完善我國航運企業和國外航運企業公平競爭的良好市場環境，針對部分航運企業惡性殺價、嚴重擾亂市場秩序的現象，交通運輸部將通過運價備案制度，從而有效規范國際班輪市場秩序。
　　宋德星表示，“各家班輪公司要按照依法經營、誠實守信的原則開展班輪運輸業務，既不能采取價格傾銷等惡性競爭行為，也不能采取集體協議限制托運人自由選擇承運人，損害托運人的合法權利。各家班輪公司要按照要求進行運價備案，并且保證運價報備信息的充分、完整和有效�！�
　　中遠集團副總裁許立榮表示，交通運輸部實施的運價備案制度對于中國班輪運輸市場意義重大，是遏制不正當競爭，維護班輪市場經營秩序的重要保障；是通過法制的手段實現船貨雙方雙贏的局面；運價備案既符合政府宏觀調控職能，也不違反市場競爭原則，將促進中國班輪行業的健康發展。
　　事實上，在過渡期內，運價報備制度也推動了行業自律進程。7月16日，14家經營日本航線的班輪公司匯聚上海航交所，經過有效溝通和協調，所有與會船公司簽署了《經營日本航線班輪公司行動守則》，共同作出承諾，絕不以“零運價”或“負運價”經營日本航線，以維護日本航線市場健康有序的競爭秩序。
　　未來面臨挑戰
　　許立榮坦言，金融危機導致貿易的低迷，使得班輪行業成為“重災區”，今年全球班輪行業的虧損將超過320億美元。而目前很多航線的運價無法彌補成本，更使得班輪公司雪上加霜。為了攬得貨源，集裝箱班輪市場運價每況愈下，過低的運價也導致市場競爭無序化，給航運企業帶來較高的經營風險。通過運價備案的方式，主管部門可以更全面地掌握運價情況，對一些惡性競爭的企業進行調查和處理。
　　記者在調查過程中了解到，伴隨著運價備案制度8月1日的全面正式實施，也面臨著一些挑戰。在45天的過渡期內，根據上海航交所的數據顯示，還有16家國際班輪公司尚未進行運價備案；從已備案數據來看，有相當一部分班輪公司備案的運價信息未覆蓋其經營的全部航線。
　　此次運價備案制度是根據國務院2002年實施的《國際海運條例》，將備案的適用地域范圍擴大到全國范圍，使得班輪公司在收集運價數據方面出現了不小的難度，不少船公司表示，在系統和時間上都存在很大挑戰。
　　除了適用地域范圍的擴大，在備案的方式、方法上也有變動�？紤]到一些大型船公司的航線數量較多，報備的工作量會比較大，此次備案，實行“幅度”報送，即報備中國港口至外國基本港的出口集裝箱貨物海運運價對外報價的上限和下限。但是最低運價的公開，可能會導致客戶都要求最低運價。如果把運價幅度收窄，那么報備的量就會很大，給運價報備工作增加難度。所以班輪公司確定備案的幅度是一個難點。
　　班輪公司反映比較集中的另一個問題是，希望加大處罰力度和加快處罰速度。有企業建議，一旦發現違規企業，在一、兩個星期內就應調查結束并公布處罰結果。如果這個過程要持續三、四個月，許多船公司就會跟進，將給合法經營的船公司帶來很大的壓力。
　　此外，目前運價備案制度只針對航運公司，因此中間商環節報出的“零運價”或“負運價”等過低運價就處于失控狀態。有分析人士指出，現在有些船公司或無船承運人(NVOCC)有許多暗箱操作。如果運價備案要真正起到效果，非常重要的一點是，相關政府職能部門要確實加大監管力度，對某些船公司不正規的行為要堅決制止，并將無船承運人納入監管的范圍。