廣州港地處我國外向型經濟最活躍的珠江三角洲地區中心，是華南地區內貿集裝箱運輸的樞紐港，外貿集裝箱運輸正向干線港發展。截至2008年底，廣州港共有專業化集裝箱泊位15個，靠泊能力3.5~10萬噸級，年吞吐能力720萬TEU。南沙港區是廣州港新開辟的深水港區，目前已經投產10個5萬噸級專業集裝箱泊位(靠泊能力10萬噸級)，年設計通過能力為600萬TEU，是廣州港目前最先進的專業化集裝箱泊位，今后將承擔廣州港的遠洋直航及近洋運輸。
目前，廣州港集裝箱吞吐量發展現狀及特點如下：
1.集裝箱吞吐量持續快速增長
廣州港的集裝箱運輸從1980年開始發展，初期的箱量一直維持在較低的水平，1990年集裝箱吞吐量僅10.9萬TEU。到1999年廣州港集裝箱吞吐量達到117.7萬TEU，成為當時第5個吞吐量突破100萬TEU的沿海港口。2008年，廣州港完成集裝箱吞吐量1100.1萬TEU，比上年增長18.8%，正式成為繼上海、深圳港之后國內第3個突破千萬箱的集裝箱大港，躋身世界十大集裝箱港口行列，列第七位。在國際金融危機爆發、全球經濟增速放緩等因素影響下，全國港口集裝箱業務均遭遇寒潮，但廣州港的集裝箱業務卻逆市增長實現了歷史性的跨越，足見發展潛力很大。
從廣州港集裝箱吞吐量的發展歷程來看，由起步到100萬TEU用了21年時間，由100萬TEU到200萬TEU用了3年時間，由200萬TEU到400萬TEU用了3年時間，由400萬TEU到1000萬TEU也僅用了3年時間，每3年實現大幅度增長，發展速度令人矚目。
2.外貿集裝箱吞吐量快速增長
2004年9月南沙港區一期工程投產前，由于航道水深和碼頭靠泊能力的限制，外貿集裝箱遠、近洋航線航班少，直航量約在3萬TEU/年左右，大部分外貿集裝箱喂給香港。隨著南沙港區一、二期工程建成投產，廣州港的外貿集裝箱直航量呈快速發展的趨勢。
2004~2008年，廣州港外貿集裝箱吞吐量年均增長25.2%，遠近洋航線吞吐量年均增長79.2%，遠洋航線吞吐量年均增長125%。2008年，廣州港完成外貿箱吞吐量368.0萬TEU，其中遠近洋航線吞吐量87.5萬TEU，占外貿吞吐量比重為23.8%。
3.水上集疏運快速發展
廣州港位于珠江入�？诤椭榻�三角洲中心地帶，擁有其它港口無法比擬的發達水網。作為珠三角西岸唯一的大型集裝箱深水港，地處珠三角中心的廣州港南沙港區區域競爭優勢尤為突出。
南沙港區地處珠江西岸，貨源主要來自于珠江三角洲中西部地區，四通八達的珠江三角洲內河航道網為集裝箱集疏運提供了便捷的水上運輸條件，從目前南沙港區集裝箱集疏運情況來看，駁船運輸所占比重相當大。
自2006年7月廣州港集團推出水上巴士與駁船業務以來，駁船支線覆蓋珠三角主要的中、小碼頭。目前與南沙港區簽訂駁運支線服務的社會駁運公司有17家，其中以公共駁船形式服務的駁運公司7家，內河港航線13條，覆蓋珠三角主要地區。
從南沙港區這幾年的發展情況來看，2005年，南沙一期駁船運輸完成的箱量為49.9萬TEU，水水中轉比例為92%；2006年駁船運輸量為99.8萬TEU，比上年翻了一番，水水中轉比例為83%；2007年，駁船運輸量為147.2萬TEU，水水中轉比例為76%，到2008年，駁船運輸量158.8萬TEU，水水中轉比例為72%。同樣，2007年南沙二期集裝箱運輸中水水中轉比例高達96%，到2008年略有下降，水水中轉比例為91.5%。
可見，目前南沙港區的集裝箱運輸水水中轉比例相當大，水上駁船運輸的開展，對吸引珠江流域的集裝箱箱源起到了積極作用，推動了南沙港區集裝箱吞吐量快速發展。
今后廣州港集團計劃繼續拓展“穿梭巴士”覆蓋范圍，借助發達的珠江水網和便利的江海聯運條件，與周邊大中小碼頭建立戰略合作伙伴關系，為建設廣州港集裝箱干線港、物流中轉港打好基礎，更深一步推動“珠江戰略”，增強廣州港的輻射能力。
4.廣州港外貿集裝箱運輸向干線港發展
廣州港優越的區位優勢。吸引了世界著名的船運公司競相參與南沙港區的合作與開發。目前，廣州港已與馬士基、中遠、中海等航運巨頭強強聯手，形成集裝箱運輸合力。廣州港南沙港區運作3年來，已引進世界著名班輪公司如馬士基、地中海、達飛、長榮、中海、中遠、赫伯羅特、日本郵船、川崎、商船三井、韓進、陽明、以星、太平船務等世界前20位的大船公司進駐。
南沙港區一、二期工程建成以來，多家中外班輪公司已在南沙港區開辟航線或開展業務，航班可直達國內各主要港口及韓國、日本、美國、東南亞、中東、歐洲及澳洲等地。截至2008年7月，南沙港區已開辟了20條外貿航線，其中遠洋航線15條，近洋航線5條。目前多家班輪公司有意在南沙港區增加或開辟遠洋航線。
目前，歐洲線、美洲線、紅海線等遠洋干線已成為廣州港集團主力外貿航線，中遠洋航線的增長，將推動廣州港集裝箱運輸向干線港發展，進一步提升了廣州港集裝箱運輸在珠三角港口群中的地位。
5.內貿集裝箱運量持續快速增長
目前廣東省內貿集裝箱運輸主要以廣州港為主，深圳港也承擔一部分，其他中小港口以喂給為主。廣州港是我國沿海內貿集裝箱吞吐量最大的港口，地處珠江口優越的區域位置使其成為華南地區最大的內貿集裝箱中轉站和全國沿海內貿集裝箱運輸中的重要組成部分。廣州港內貿集裝箱運輸于1996年起步，當年吞吐量僅3萬TEU。2003年廣州港內貿集裝箱吞吐量已超過100萬TEU，達到153萬TEU。發展內貿集裝箱運輸以來，吞吐量高速度增長，成為廣州港集裝箱吞吐量的主要增長點。2008年廣州港完成內貿集裝箱732.1萬TEU，比上年增長23.4%。目前內貿集裝箱貨物已從起步階段的大宗陶瓷制品過渡到電器、紙類、家具、設備等多種貨類，隨著整個國家宏觀經濟新一輪的啟動，東部沿海地區的經濟發展和貿易增加，廣州港為沿海集裝箱運輸的發展提供了更廣闊的市場前景。