香港船舶注冊所實施的政策原意是為所有香港船東改進服務的，但由于政策具權威性和通用性，受到臨近地區的船公司和船東的歡迎，為海事處帶來意想不到的效果與收穫。廖漢波介紹，現時船舶注冊盈余累計金額數以千萬元計，未來還會進一步增長。如何進一步合理運用這一豐厚的收入，需要深入研究。他強調注冊費用高低不能與船舶質量相提并論。 
當談及前海事處處長譚百樂曾表示，對香港船舶注冊總噸達6700萬噸感驚訝，廖漢波亦感同身受，他表示，“這一數字，對于整個海事處來說，都是始料不及的�！� 
廖漢波指出，香港97年回歸時，由于船東對香港未來的信心問題，船舶注冊噸位曾跌至500萬總噸，但隨著社會穩定和經濟發展的不斷變化，近年來船東對香港船舶注冊愈來愈有信心，注冊船舶數更是成倍增加，日積月累，收益已過千萬元。他解釋道，“根據政府對該項目原本設定的‘用者自付’原則，注冊所收取的費用是盡可能支付行政使費，做到收支平衡，但政策所發揮的效力，盈餘滾存愈來愈大之后，處方以所得減少注冊費用，回饋給船東。另外，海事處針對不同船型收取相應注冊費用，是設上限的，而非噸位的大小。” 
他舉例，“除了船舶注冊，其他方面亦有減費，如港澳客運碼頭的登船費，已從多年前的每人20多元降至現時的10多元，減少近倍�！钡�他未有說明除減費外，未來這筆收入的去向。 
另外，廖漢波擔心注冊費用年年遞減，導致不少船東認為“平野無好貨”，他鄭重其事指出，“倘若以這種觀點來衡量，絕對是一項謬論。注冊費用與船舶質量不成正比，香港船舶注冊不是‘方便旗’，海事處始終將船舶質量放在第一位來看待�！� 
有業內人士認為，若不繼續實行減費制度，船舶注冊費用所得必將越滾越大，他們呼吁海事處推出明確指引，妥善運用資金，并建議將這筆資金放在對未來海事培訓和海事宣傳教育用途。