由于地震和海嘯的破壞，很多港口因為受損嚴重而關閉。另外一些受損較小的港口也由于等待損失評估而暫時關閉。  
　　ISS向協會提供了日本港口和碼頭受損情況的最新情況表。其中下面這些港口遭到了非常嚴重的破壞，由南至北依次為：Kashima, Hitachinaka, Hitachi, Onahama, Soma, Sendai, Shiogama, Ishinomaki, 
Kesennuma, Ofunato,Kamashi, Miyako 和 Hachinohe。這些港口可能需要幾個月甚至幾年時間才能恢復正常營運。 
　　其他港口基本運作正常， 建議船東與協會具體聯系確認。主要的鋼鐵制造企業比如Nippon Steel, JFE 和Sumitomo Metal主要使用Muroran, Kashima, Kimitsu (Kisarazu), Kawasaki, Nagoya, Wakayama, Kakogawa, 
Mizushima,
　　Fukuyama, Oita等港口，沒有受到直接的破壞和影響。唯一被破壞的是Sumitomo Metal位于鹿島Kashima的碼頭。 
　　另外，絕大部分日本造船廠位于日本南部，不在嚴重受災區域內，沒有受到地震和海嘯的影響。