據介紹，閩江馬尾對臺綜合客運碼頭1號-3號泊位工程總投資約2.4億，將建設三個泊位及其相應配套設施，其中1號泊位為5000噸級客貨泊位，設計年貨物通過能力25.2萬噸，年旅客通過能力3.3萬人次；2號與3號泊位為2個500噸級客運泊位，設計年旅客通過能力53.1萬人次。該項目一期總體規劃分為貨運區、客運區兩部分。貨運區包括口岸檢驗區以及輔助生產建筑區�？瓦\區占地面積約54.9畝，包括客運大樓、站前廣場。
工期緊、任務重的壓力倒逼了閩江馬尾對臺客運碼頭的前期征地工作與建設方案的優化。
自今年1月11日動員部署閩江馬尾對臺綜合客運碼頭項目的征地工作以來，瑯岐鎮以23天完成了130畝的征地量。
中交二航局項目經理袁錫權告訴記者，為保證項目質量，項目經過多次方案設計修改，加大投入人力、物力以及設備�！坝捎诋數嘏_風多、雨水多，且地質淤泥多，發生沉降是無可避免的問題，這對水上施工沒有影響，但卻對陸上施工考驗重重�！睘榱俗岅懮鲜┕さ某两当３衷诳煽胤秶�，中交二航局將采用5種特殊軟基處理，包括運用砂樁處理、淤泥管樁處理等技術。
建成后，瑯岐碼頭到馬祖“南竿”的直線距離為18海里，外地來瑯岐碼頭從長樂機場到達碼頭，車程20分鐘；福州市區客人可以走東部快速通道過瑯岐閩江大橋到達碼頭，車程為30分鐘。
