雙方將采取一切可行措施開展互助與合作，特別是在港口相關項目研究，碼頭運營管理、海運管理，港口安全和航道安全，港口船舶運輸管理系統的組織和運行等業務培訓，港口統計數據、裝卸貨物、兩港間船舶流動、船東政策等信息交流，港口設備、設施和儀器使用的技術協助，以及雙方運輸往來等多個方面的合作，提升兩港國際影響力，在“一帶一路”、海絲核心區的建設中發揮更大作用。

　　馬來西亞有巴生、民都魯、柔佛、關丹、檳城、馬六甲等主要港口。其中馬六甲港位于世界航運咽喉馬六甲海峽中段，馬來西亞首都吉隆坡和新加坡之間，為“一帶一路”重要節點。近年來，馬六甲港皇京新港區開發因其獨特的區位優勢，得到國際航運界關注。2016年10月，中國電建集團開始承建皇京新港深水補給碼頭，預計2019年完工，整個皇京新港開發將于2025年完成。2016年，廣州港與馬六甲港締結為友好港。

　　福州港是東南沿海主要港口，“海上絲綢之路”發源地，“一帶一路”建設的重要節點，對臺“三通”的重要口岸，也是建設“海上福州”的重要支撐。按照2015年11月中馬兩國交通部長簽署的《建立港口聯盟關系諒解備忘錄》，福州港是中馬港口聯盟中方11個港口之一。2015年10月，省福州港口管理局與馬來西亞巴生港務局簽訂友好港諒解備忘錄。今年初以來，福建省福州港口管理局和馬六甲港務局加強對接，雙方對締結友好港口表示出強烈意愿。